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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 实验结果与分子模拟结果不一样，怎么办？
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悠然南子

铁虫 (初入文坛)

[求助] 实验结果与分子模拟结果不一样，怎么办？ 已有1人参与

各位前辈，老师：
我做曙红B与罗丹明B这两种染料与BSA的吸附实验，实验结果显示一个BSA可以吸附1个罗丹明B或吸附3个曙红B。
实验结果与分子模拟结果不一样，怎么办？罗丹明B
实验结果与分子模拟结果不一样，怎么办？-1曙红B

导师让我用autodock模拟一下这两个分子在BSA上的结合情况。
我在RCSB上下载了三种BSA做对接，名称分别是4F5S（1个对接位点）、4JK4（4个对接位点）、4OR0（3个对接位点）。对接结果是前两种对接不上（affinity大于0），只有最后的4OR0显示这两种分子与其有亲和力。
实验结果与分子模拟结果不一样，怎么办？-2这是对接后的数据

但是问题来了，4OR0与这两种分子对接后显示能吸附2个罗丹明B、或吸附1个曙红B。
这与实验结果严重不符。我该怎么办？请问有什么解决办法吗？
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1楼 2016-01-04 17:23:47
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忧伤说笑

木虫 (正式写手)
实验结果是怎么测定的？

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8楼2020-09-08 15:08:56
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zhad33

铜虫 (初入文坛)
肯定看实验结果吧，对接本来就不是准确的

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stayrealkids~
3楼2016-01-07 12:17:47
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Soledum

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

以实验结果为准！对接的目的在于预测试验结果。
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4楼2016-01-07 22:46:48
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侯木虫

新虫 (小有名气)
实验结果跟对接不一样能写一篇文章么？

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5楼2018-07-17 23:59:15
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