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吉米爱多铁杆木虫 (著名写手)
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关于Gromacs压力耦合方式的设置
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附图中，“蒙脱石+水”图是我的模拟体系。我用NPT预平衡的时候，采用了semi--isotropic的压力耦合，发现实际压力距离设定值差别很大（“压力”图），Z方向的压力基本和设定的500bar接近，但是在X/Y方向，压力距离设定的500bar差得很远。“mdp参数”图是我的压力耦合这块的参数。 请教各位，有没有设置过semiisotropic的，可否借鉴下你们这块压力耦合的设置？  mdp参数.jpg  蒙脱石+水.jpg  压力.jpg |
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