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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 看不懂PFAM怎么办，想下载一个模型，不会搞
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FreedoMMM

新虫 (初入文坛)

[求助] 看不懂PFAM怎么办，想下载一个模型，不会搞 已有1人参与

最近开始接触生物信息学分析的东西，想利用黄瓜的全基因组数据库，找出全部的NAC转录因子基因，看到很多文献上都提到第一步是从pfam下载一个隐形马氏模型，头都大了
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1楼 2015-12-25 22:42:34
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911911abc

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by FreedoMMM at 2015-12-28 12:51:56
恩恩  这个找到了，对应的HMM文件也下载了，然后是用hmmer软件比对是吗？请问这个软件怎么用啊，好像涉及到一些编程的东西。。...

你好 我最近也在研究生物信息学方面的东西 想请教你一下 你那个HMM模型是怎么下载的？  还有你所说的登录号是指的某个转录因子的号码 是不是以PF开头的啊
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9楼2016-01-02 20:19:52
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金娜儿

新虫 (初入文坛)
有登录号吗

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2楼2015-12-25 22:49:29
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FreedoMMM

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 金娜儿 at 2015-12-25 22:49:29
有登录号吗

什么是登录号啊
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3楼2015-12-25 22:56:13
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金娜儿

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by FreedoMMM at 2015-12-25 22:56:13
什么是登录号啊

我从文献里找了相关登录号，登录的pfam

发自小木虫Android客户端
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4楼2015-12-27 23:04:15
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