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1002432022

金虫 (小有名气)

[求助] 请教一个酵母单杂交的问题 已有2人参与

最近做单杂实验发现一个怪问题,我做点对点的。我把要验证的转录因子构建到pGADT7-rec2载体上,与pHis2的空载共同转化Y187,本来要拿这个做阴性对照的,可是在三缺板子上长得很欢乐呀,加了3AT,并且已经加的浓度很高了,还是生长!但是我的实验组,就是转录因子构建到pGADT7-rec2载体上,目标启动子构建到pHis2载体上共同转化Y187,在三缺板上长,加了3AT之后反倒不长了!有没有大神遇到过类似问题,或者帮忙解释一下?
还有一点,我看了pHIS2的序列,在HIS3前面,Pmin区域里也有我的转录因子结合位点,会不会是我的转录因子结合到那里去了?不知道有没有这个可能性啊?这个minimum promoter是不是只有GAL4AD才能结合呢?如果非要做,这段区域能不能改造呢?求指点啊~
还有,我也试过了pAbAi系统的,一样的问题,只转了空载pAbAi,然后再把我的转录因子构建在pGADT7上,转化,AbA已经加到3ug/ml了,还是生长!求指点这种激活空载的问题怎么解决啊~~~
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zhangleisdau

铁虫 (正式写手)

楼主你好,我也遇到你的问题了,问遍了所有人都没有问到。阴性对照(转录因子构建到pGADT7-rec2载体,以及空载的phis2共转)在三缺的板子上(添加3AT)长,而实验组(转录因子构建到pGADT7-rec2载体,以及启动子的phis2共转)也不长。如果像楼主说的,Pmin区域里也有转录因子结合位点,那构建含有目标启动子的phis2载体的时候,这个载体也是有Pmin区域的,这样的话,实验组也应该是长的啊。
请问楼主解决问题了吗?跪求指点啊!
16楼2019-07-31 21:49:18
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piaoyidetian

新虫 (初入文坛)

我准备开始做酵母单杂交,但是启动子区域的选择想请教一下?是选取ATG上游2000的片段,然后整个连到pHIS2载体上吗?
2楼2016-01-14 15:29:38
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1002432022

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by piaoyidetian at 2016-01-14 15:29:38
我准备开始做酵母单杂交,但是启动子区域的选择想请教一下?是选取ATG上游2000的片段,然后整个连到pHIS2载体上吗?

我之前做了直接取ATG上游1.5k构建到phis2上,感觉不合适。最好还是找到自己转录因子的结合motif然后取motif和其上下游几十bp的片段,然后串联3个片段构建载体比较合适。
3楼2016-02-04 19:53:25
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张凡云

至尊木虫 (职业作家)

我们用的AH109菌株,载体是pBridge,所以木有遇到你说的这些问题

发自小木虫IOS客户端
4楼2016-02-05 08:42:12
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