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llaall_123

[交流] 崩溃了,求助RT-PCR

做了快两个月的RT,一直做的不好。

我是处理细胞后,测定细胞c-myc的表达变化。
前期是用没有处理的细胞摸条件,不太稳定,有时出,有时不出。而且我的大部分是要么内参,目的都不出;要么都出。要么一出条带就很漂亮,要么啥都没有。摸温度也是,要么那几个温度都出,亮度也差不多,要么什么都没有,有是连引物二聚体也没有。后来我调整了引物,模板量。把引物加倍。其中单独引物加倍,或者引物、模板都加倍的情况比较稳定。

我以为就可以了,然后处理细胞。结果一到正式做的时候又不稳定了,有时有,有时没。

开始以为是提取的问题,可是每次提取的时候都测定浓度,都跑电泳。比值大约在2,电泳条带也是三条都有,28S是18S的两倍,5S很淡。觉得提取应该没有问题。然后是PCR,我后来用TAKARA的试剂盒,可还是出现不稳定。首先用试剂盒,加样的误差也不大。而且用试剂盒作出来过,还是新分装的,应该也不会有多大问题。

我一直在想是不是反转录的问题,用的TAKARA的MMLV,按照说明操作,每次上样500ng。我不知道怎样检测反转录成工了,有人说用内参,要是内参没有出的话,是不是代表没转录成功。感觉也很少有人在反转录出问题。大多人好象是内参出了,目的没出。

时间也不多了,钱也花了不少,还做不出来。马上要毕业了,实在是着急。

请各位老师朋友指点指点,谢谢!
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xujian568

至尊木虫 (著名写手)

Count XU

有可能是仪器的问题,建议楼主换一台试试。
还有就是让实验室的其他人帮你加一次样做一次,有可能是试验操作哪个地方出现了楼主不知道的问题。
活着就要让人感受到你的存在。
4楼2008-09-22 22:06:21
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

现在开始怀疑是仪器有问题……稳定性这么差
做普通PCR会不会也这么不稳定?
2楼2008-09-21 23:19:01
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llaall_123

感觉仪器不太可能,当天有别人也在跑PCR,好象也还出了。
3楼2008-09-22 17:06:27
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llaall_123

引用回帖:
Originally posted by llaall_123 at 2008-9-22 17:06:
感觉仪器不太可能,当天有别人也在跑PCR,好象也还出了。

恩,我试试,谢谢:)
5楼2008-09-24 09:20:08
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