24小时热门版块排行榜    

查看: 1285  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

匿名

用户注销 (小有名气)

本帖仅楼主可见
已阅   同方向广播   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

andyduan

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

6楼2016-01-19 00:11:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

匿名

用户注销 (小有名气)

本帖仅楼主可见
3楼2015-12-09 23:09:15
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
leekacle: 金币+10, 这是什么东东啊? 2015-12-12 19:34:30
The PredictProtein server也许是进行蛋白质结构分析中最复杂的站点了,然而由Columbia University维护的原始网站非常繁忙,对你提交的预测工作的响应时间可能超过一两天。好在PredictProtein server在世界各地有很多镜像站点,包括欧洲、美国、亚洲以及澳大利亚。下面是一些PredictProtein server的网址:
Europe:

www.embl-heidelberg.de/predicprotein/
www.cmbi.kun.nl/bioinf/predictprotein/
USA:

cubic.bioc.columbia.edu/predictprotein/  
www.sdsc.edu/predictprotein/ .  

你可以用一条序列试一下哪一个服务器比较适用。一般说来,PredicProtein的缺省分析包括了如下的内容:

* A secondary structure prediction on the three conformational states

(H=Helical, E=extended, and C=Random coil)  

* A prediction of the solvent accessibility of the various residues

* A prediction of transmembrane helices and their topology

* A prediction of globular regions in your protein  

* A prediction of the coiled/coil regions of your protein  

*

A description of the PROSITE motifs matching your sequence (for more on PROSITE mitifs)  

* A description of the putative domain structure for your sequence (Prodom domain)

* A prediction of bound cysteines (disulphide bonds) in your sequence

* A description of the composition-biased regions in your sequence  

注意:上述各种特性是否能在返回给你的结果中显示依赖于你的查询序列中是否含有它们。

  













www.cmbi.kun.nl/bioinf/predictprotein/





USA:







cubic.bioc.columbia.edu/predictprotein/






















www.sdsc.edu/predictprotei
mgfudan
4楼2015-12-12 11:38:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (小有名气)

本帖仅楼主可见
5楼2015-12-13 13:54:21
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +29 医学老男孩 2026-08-13 63/3150 2026-08-15 22:12 by 医学老男孩
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +8 majunge000 2026-08-11 10/500 2026-08-15 18:55 by Equinoxhua
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +7 Ldrop2023 2026-08-13 7/350 2026-08-15 15:57 by mzhh2000
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
信息提示
请填处理意见