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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » NAMD中ABF计算自由能
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素君~~~

银虫 (小有名气)

[交流] NAMD中ABF计算自由能

各位大神们，在NAMD中ABF计算平均力势应该算是一种很普遍的方法了，猜测应该有很多高手做过这个，所以希望大家赐教。现在开始学习自由能，感觉不是很容易弄懂，希望可以和大神们沟通交流，谢谢大家。
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1楼 2015-12-07 20:43:17
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krh1

铁虫 (著名写手)
★
素君~~~(金币+1): 谢谢参与
呵呵

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4楼2015-12-07 20:57:50
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hubaolong370

至尊木虫 (文坛精英)
★
素君~~~(金币+1): 谢谢参与
祝好

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11楼2015-12-07 21:21:21
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exilecxl

至尊木虫 (著名写手)
★
素君~~~(金币+1): 谢谢参与
帮顶

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21楼2015-12-07 21:54:32
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xcmrxcmr

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
abf并不好用，推荐metadynamic

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34楼2015-12-07 23:16:30
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素君~~~

银虫 (小有名气)
引用回帖:
34楼: Originally posted by xcmrxcmr at 2015-12-07 23:16:30
abf并不好用，推荐metadynamic

可是我现在在学这种方法，所以要先把这个学会。
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35楼2015-12-08 14:18:19
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我无语了123

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这种自适应偏置力的方法官网上有，其实归根结底还是us方法最认可，而且这种方法计算量也不见，小到哪里去。上边说了变化动力学也不错的。
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36楼2015-12-21 18:03:59
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longwave2楼
2015-12-07 20:55   回复  
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dmbb3楼
2015-12-07 20:57   回复  
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Jameskelly5楼
2015-12-07 21:05   回复  
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马小晴cc6楼
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马小晴cc7楼
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springburn8楼
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德耶谬9楼
2015-12-07 21:16   回复  
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skyish10楼
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hbl21512楼
2015-12-07 21:31   回复  
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star_zhang13楼
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电子云14楼
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llwff15楼
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tableman16楼
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葛丹丹17楼
2015-12-07 21:46   回复  
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caledonian18楼
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meng焕19楼
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meng焕20楼
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toplentl22楼
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yinhangka23楼
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天大我来了24楼
2015-12-07 22:06   回复  
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heena25楼
2015-12-07 22:08   回复  
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ccblovelr26楼
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tzynew27楼
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shibiema28楼
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shinesun9829楼
2015-12-07 22:28   回复  
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yuzhuce30楼
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fdzjm31楼
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syhorchid32楼
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zhoushanqun33楼
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