应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 获取基因序列
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
81/1返回列表
查看: 796  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

星星chanyeol

新虫 (初入文坛)

[求助] 获取基因序列 已有1人参与

各位师兄师姐们，请问大家：我有个基因的ID，但是在NCBI和Genbank上都没有搜到，是因为还没有注册吗？
还有怎样获得一种酶的基因序列呢？本身实在菜鸟级别 望相助.谢谢各位啦
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2015-12-07 17:39:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有ID号查不到序列有可能是作者在提交序列时选择了延迟释放数据。如果只有酶的名称，那就直接在NCBI上用酶的名称去检索，如果有酶的蛋白质序列，那就用蛋白质序列去做tblastn搜索。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

星星chanyeol
2楼2015-12-08 01:25:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

星星chanyeol

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-12-08 01:25:53
有ID号查不到序列有可能是作者在提交序列时选择了延迟释放数据。如果只有酶的名称，那就直接在NCBI上用酶的名称去检索，如果有酶的蛋白质序列，那就用蛋白质序列去做tblastn搜索。

用名称去检索 会出现许多其他植物的这种酶序列 太多了然后就不知道怎么办了
获取基因序列



发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
3楼2015-12-08 15:59:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 星星chanyeol at 2015-12-08 15:59:42
用名称去检索 会出现许多其他植物的这种酶序列 太多了然后就不知道怎么办了

...

你是什么物种呢？限定下物种范围检索就可以了。
赞一下 回复此楼
4楼2015-12-09 00:10:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

星星chanyeol

新虫 (初入文坛)
是桃子 限定了之后也没找到这类蛋白的序列 不知道什么原因

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
5楼2015-12-09 00:20:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

星星chanyeol

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by stone2239 at 2015-12-09 00:10:44
你是什么物种呢？限定下物种范围检索就可以了。...

是桃子 限定了之后也没找到这类蛋白的序列 不知道什么原因

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
6楼2015-12-09 00:21:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 星星chanyeol at 2015-12-09 00:21:25
是桃子 限定了之后也没找到这类蛋白的序列 不知道什么原因
...

桃也有的，你可以看下EMJ28312、EMJ27631、EMJ26906等序列，这些是自动注释的结果，这些序列中都有invertase inhibitor的结构域。另外你也可以用其他植物比如拟南芥的该蛋白序列在桃的库中做blastp，这样通过相似性搜索应该也能找到。
赞一下 回复此楼
7楼2015-12-10 00:01:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

星星chanyeol

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by stone2239 at 2015-12-10 00:01:33
桃也有的，你可以看下EMJ28312、EMJ27631、EMJ26906等序列，这些是自动注释的结果，这些序列中都有invertase inhibitor的结构域。另外你也可以用其他植物比如拟南芥的该蛋白序列在桃的库中做blastp，这样通过相似性 ...

谢谢了啊。

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
8楼2015-12-31 08:31:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 星星chanyeol 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿中国石油大学化学工程323分求调剂 +4 化工专硕323分 2026-04-03 6/300 2026-04-03 22:12 by dongzh2009
[考研] 293求调剂 +5 末未mm 2026-04-02 6/300 2026-04-03 15:20 by 王保杰33
[考研] 材料与化工306分找调剂 +22 沧海轻舟e 2026-04-02 23/1150 2026-04-03 15:08 by hypershenger
[考研] 求调剂 +3 心想事成可 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:22 by wangjy2002
[考研] 325分化学调剂 +5 15771691647 2026-04-02 5/250 2026-04-03 09:58 by ChemPharm
[考研] 312求调剂 +4 赊月色 2026-04-02 5/250 2026-04-03 08:21 by fangshan711
[考研] 296求调剂 +4 sdhu 2026-04-02 4/200 2026-04-02 21:29 by baoball
[考研] 一志愿武汉理工0856，初试334 +3 26考研材料 2026-04-02 3/150 2026-04-02 21:22 by dongzh2009
[考研] 材料340分调剂 +7 夏夜晚风_long 2026-04-02 9/450 2026-04-02 21:20 by dongzh2009
[考研] 293求调剂 +4 珂珂乐 2026-04-02 4/200 2026-04-02 20:10 by 6781022
[考研] 一志愿北京科技大学085601材料工程英一数二初试总分335求调剂 +8 双马尾痞老板2 2026-04-02 9/450 2026-04-02 14:45 by 5896
[考研] 08工科求调剂290分 +5 1314捧花 2026-04-02 8/400 2026-04-02 13:16 by 乔哒哒哒
[考研] 材料化工340求调剂 +5 jhx777 2026-03-30 5/250 2026-04-02 12:45 by smileboy2006
[考研] 372求调剂 +3 jj涌77 2026-04-02 3/150 2026-04-02 09:57 by olim
[考研] 土木304求调剂 +6 兔突突突， 2026-03-31 7/350 2026-04-02 09:06 by coolminer
[考研] 353求调剂 +4 拉钩不许变 2026-04-01 4/200 2026-04-01 18:10 by 记事本2026
[考研] 一志愿北交材料工程总分358 +5 cs0106 2026-04-01 7/350 2026-04-01 11:45 by wangjy2002
[考研] 333求调剂 +4 阿科逸 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:11 by jp9609
[考研] 323分 食品与营养调剂 +3 嘿ooo 2026-03-31 3/150 2026-03-31 09:38 by longlotian
[考研] 086000生物与医药调剂 +5 Feisty。 2026-03-28 9/450 2026-03-29 12:02 by longlotian
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭