应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 获取基因序列
81/1返回列表
查看: 884  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

星星chanyeol

新虫 (初入文坛)

[求助] 获取基因序列 已有1人参与

各位师兄师姐们，请问大家：我有个基因的ID，但是在NCBI和Genbank上都没有搜到，是因为还没有注册吗？
还有怎样获得一种酶的基因序列呢？本身实在菜鸟级别 望相助.谢谢各位啦
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2015-12-07 17:39:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有ID号查不到序列有可能是作者在提交序列时选择了延迟释放数据。如果只有酶的名称，那就直接在NCBI上用酶的名称去检索，如果有酶的蛋白质序列，那就用蛋白质序列去做tblastn搜索。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

星星chanyeol
2楼2015-12-08 01:25:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

星星chanyeol

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-12-08 01:25:53
有ID号查不到序列有可能是作者在提交序列时选择了延迟释放数据。如果只有酶的名称，那就直接在NCBI上用酶的名称去检索，如果有酶的蛋白质序列，那就用蛋白质序列去做tblastn搜索。

用名称去检索 会出现许多其他植物的这种酶序列 太多了然后就不知道怎么办了
获取基因序列



发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
3楼2015-12-08 15:59:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 星星chanyeol at 2015-12-08 15:59:42
用名称去检索 会出现许多其他植物的这种酶序列 太多了然后就不知道怎么办了

...

你是什么物种呢？限定下物种范围检索就可以了。
赞一下 回复此楼
4楼2015-12-09 00:10:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

星星chanyeol

新虫 (初入文坛)
是桃子 限定了之后也没找到这类蛋白的序列 不知道什么原因

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
5楼2015-12-09 00:20:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

星星chanyeol

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by stone2239 at 2015-12-09 00:10:44
你是什么物种呢？限定下物种范围检索就可以了。...

是桃子 限定了之后也没找到这类蛋白的序列 不知道什么原因

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
6楼2015-12-09 00:21:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 星星chanyeol at 2015-12-09 00:21:25
是桃子 限定了之后也没找到这类蛋白的序列 不知道什么原因
...

桃也有的，你可以看下EMJ28312、EMJ27631、EMJ26906等序列，这些是自动注释的结果，这些序列中都有invertase inhibitor的结构域。另外你也可以用其他植物比如拟南芥的该蛋白序列在桃的库中做blastp，这样通过相似性搜索应该也能找到。
赞一下 回复此楼
7楼2015-12-10 00:01:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

星星chanyeol

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by stone2239 at 2015-12-10 00:01:33
桃也有的，你可以看下EMJ28312、EMJ27631、EMJ26906等序列，这些是自动注释的结果，这些序列中都有invertase inhibitor的结构域。另外你也可以用其他植物比如拟南芥的该蛋白序列在桃的库中做blastp，这样通过相似性 ...

谢谢了啊。

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
8楼2015-12-31 08:31:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 星星chanyeol 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +15 爱看书的可乐 2026-08-26 17/850 2026-08-27 09:52 by xxniao123
[基金申请] 基金不中，共勉 +7 eulota 2026-08-26 7/350 2026-08-27 09:02 by hsding2026
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 怎么查啊 +5 huang1991js 2026-08-26 5/250 2026-08-26 16:09 by Equinoxhua
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭