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luckzhmliu

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 晶体checkcif文件没有A,B类错误,但C类错误Rint值0.17较大,怎么办? 已有2人参与

本人有一个有机配体的晶体结构,已经解析出结构,checkcif没有A、B类错误,当时就认为可以发表。稿件投出很久,现在审稿人回复邮件如下:

1 please re-refine the structure with standard uncertainties for the lattice constants.
2 please explain why some reflections are much to weak, and why the Rint is as bad as it is.
3 please provide the experimental information on data collection, diffractometer type, scan mode etc.
4 please add a checkcif file, which fits to the submitted cif file.


麻烦高手们帮忙看看这个是什么情况?怎么回复比较好呢?多谢多谢!
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xwnail2003

禁虫 (著名写手)

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6楼2017-07-09 06:40:06
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luckzhmliu

铁杆木虫 (正式写手)

checkcif后的c类错误如下:
Alert level C
RINTA01_ALERT_3_C  The value of Rint is greater than 0.12
             Rint given   0.174
STRVA01_ALERT_2_C           Chirality of atom sites is inverted?
            From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack    5.000
            From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack_su    3.000
PLAT048_ALERT_1_C MoietyFormula Not Given (or Incomplete) ........     Please Check
PLAT141_ALERT_4_C s.u. on a - Axis Small or Missing ..............    0.00000 Ang.  
PLAT142_ALERT_4_C s.u. on b - Axis Small or Missing ..............    0.00000 Ang.  
PLAT143_ALERT_4_C s.u. on c - Axis Small or Missing ..............    0.00000 Ang.  
PLAT151_ALERT_1_C No s.u. (esd) Given on Volume ..................     Please Do !
PLAT234_ALERT_4_C Large Hirshfeld Difference N1     --  C1      ..       0.18 Ang.  
PLAT340_ALERT_3_C Low Bond Precision on  C-C Bonds ...............    0.00735 Ang.
2楼2015-12-06 22:38:31
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
luckzhmliu: 金币+5, 有帮助, 非常感谢您的帮助! 2015-12-08 09:39:27
1,你的晶包参数没有不确定度,需要给出,
2,解释为什么衍射点弱,Rint值高,
3,给出数据收集的信息,探测器类型
4,给个check CIF报告,和最终的CIF一致的报告

发自小木虫Android客户端
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
3楼2015-12-06 23:10:29
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
luckzhmliu: 金币+15, ★★★很有帮助 2015-12-08 09:39:03
Rint值过大是无法通过精修来改善的,只能重新培养或挑选晶体,重新收录数据。其他的问题倒是可以通过精修和编辑改掉。
4楼2015-12-07 08:27:45
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