24小时热门版块排行榜    

查看: 1922  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

liujinbing_2007

至尊木虫 (著名写手)

[求助] autodock模拟酪氨酸酶与抑制剂的相互作用 已有3人参与

autodock模拟其他不含金属离子的酶与抑制剂的相互作用可以对接上,但一用酪氨酸酶后就对接不上了,请专家指点迷津,谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liujinbing_2007

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by mgfudan at 2015-12-05 09:42:17
如果你确定该离子不参与与小分子抑制剂的相互作用,应该对结构没有大的影响,只会简化运算。
可以替代,这个要先重新修理一下你的蛋白。...

铜离子参与相互作用,因为铜离子是活性中心
9楼2015-12-05 09:53:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把镁离子删除后,加氢,再对接。
mgfudan
2楼2015-12-05 08:54:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liujinbing_2007

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mgfudan at 2015-12-05 08:54:26
把镁离子删除后,加氢,再对接。

应该是把铜离子删除?酪氨酸酶中含有铜离子
3楼2015-12-05 08:58:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan

引用回帖:
3楼: Originally posted by liujinbing_2007 at 2015-12-05 08:58:38
应该是把铜离子删除?酪氨酸酶中含有铜离子...

把多余的金属离子的和其他用于培养晶体的额外的小分子都删除,在做DOCK试一试。
mgfudan
4楼2015-12-05 09:06:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +9 基诺咪客 2026-08-17 12/600 2026-08-19 09:49 by niuniu-1234
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +5 Tide man 2026-08-14 6/300 2026-08-19 09:41 by zyqchem
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +52 医学老男孩 2026-08-13 114/5700 2026-08-19 09:38 by 医学老男孩
[基金申请] 今天放榜吗? +9 布布和一二 2026-08-19 9/450 2026-08-19 09:33 by zqycae
[基金申请] 什么时候开奖? +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 朋友圈看到的 +5 wangzilk 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:05 by luw152
[基金申请] 不应该看fileCode +8 且听虎啸 2026-08-12 10/500 2026-08-19 08:03 by luw152
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +4 Tide man 2026-08-12 5/250 2026-08-19 07:41 by 201120518022
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +10 yuleib84 2026-08-18 11/550 2026-08-19 07:30 by 羽毛枫f
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +3 瞬息宇宙 2026-08-15 3/150 2026-08-18 21:40 by xiaohuixin
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 9/450 2026-08-18 20:09 by 奶牛小黑
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
信息提示
请填处理意见