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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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liujinbing_2007

至尊木虫 (著名写手)

[求助] autodock模拟酪氨酸酶与抑制剂的相互作用 已有3人参与

autodock模拟其他不含金属离子的酶与抑制剂的相互作用可以对接上,但一用酪氨酸酶后就对接不上了,请专家指点迷津,谢谢!
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liujinbing_2007

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by mgfudan at 2015-12-05 09:42:17
如果你确定该离子不参与与小分子抑制剂的相互作用,应该对结构没有大的影响,只会简化运算。
可以替代,这个要先重新修理一下你的蛋白。...

铜离子参与相互作用,因为铜离子是活性中心
9楼2015-12-05 09:53:19
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mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把镁离子删除后,加氢,再对接。
mgfudan
2楼2015-12-05 08:54:26
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liujinbing_2007

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mgfudan at 2015-12-05 08:54:26
把镁离子删除后,加氢,再对接。

应该是把铜离子删除?酪氨酸酶中含有铜离子
3楼2015-12-05 08:58:38
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mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan

引用回帖:
3楼: Originally posted by liujinbing_2007 at 2015-12-05 08:58:38
应该是把铜离子删除?酪氨酸酶中含有铜离子...

把多余的金属离子的和其他用于培养晶体的额外的小分子都删除,在做DOCK试一试。
mgfudan
4楼2015-12-05 09:06:47
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