应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » autodock模拟酪氨酸酶与抑制剂的相互作用
51/1返回列表
查看: 1882  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

liujinbing_2007

至尊木虫 (著名写手)

[求助] autodock模拟酪氨酸酶与抑制剂的相互作用 已有3人参与

autodock模拟其他不含金属离子的酶与抑制剂的相互作用可以对接上，但一用酪氨酸酶后就对接不上了，请专家指点迷津，谢谢！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

药物化学

» 猜你喜欢
1楼 2015-12-05 08:46:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan
引用回帖:
7楼: Originally posted by liujinbing_2007 at 2015-12-05 09:32:58
没有增加电荷，删除了后对结果有没有影响？另外我想用锌离子代替铜离子是否可行？...

如果你确定该离子不参与与小分子抑制剂的相互作用，应该对结构没有大的影响，只会简化运算。
可以替代，这个要先重新修理一下你的蛋白。
赞一下 回复此楼
mgfudan
8楼2015-12-05 09:42:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
把镁离子删除后，加氢，再对接。
赞一下 回复此楼
mgfudan
2楼2015-12-05 08:54:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liujinbing_2007

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mgfudan at 2015-12-05 08:54:26
把镁离子删除后，加氢，再对接。

应该是把铜离子删除？酪氨酸酶中含有铜离子
赞一下 回复此楼
3楼2015-12-05 08:58:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan
引用回帖:
3楼: Originally posted by liujinbing_2007 at 2015-12-05 08:58:38
应该是把铜离子删除？酪氨酸酶中含有铜离子...

把多余的金属离子的和其他用于培养晶体的额外的小分子都删除，在做DOCK试一试。
赞一下 回复此楼
mgfudan
4楼2015-12-05 09:06:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭