24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2772  |  回复: 22

sheep916628

新虫 (小有名气)

[求助] 关于高斯计算配合物结构和能量中出现的问题(配位键变成了实键) 已有2人参与

打算用高斯09算一个含铜配合物的结构和能量,图1是计算好的配合物的构型,中间肉色的是Cu原子,图2图3是用到的计算参数,原始结构图如图4所示,发现原先配合物中的配位键变成了实键,还有发生断裂的情况,请问是不是我原始结构图搭错了还是我计算参数出现了问题?谢谢各位,求帮助啊~~~

关于高斯计算配合物结构和能量中出现的问题(配位键变成了实键)


关于高斯计算配合物结构和能量中出现的问题(配位键变成了实键)-1
3.png


关于高斯计算配合物结构和能量中出现的问题(配位键变成了实键)-2
4.jpg


关于高斯计算配合物结构和能量中出现的问题(配位键变成了实键)-3
2.png
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

八龙尊者 计算化学

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

三方石墨

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 15:09:34
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 15:10:06
sheep916628: 金币+5, 有帮助, 谢谢说明 2015-12-07 14:57:30
没有问题,高斯默认:当键长较短时画做实键,高于一个设定值(常见中心离子配合物一般2埃多点)时,不显示键。
楼主可以回想一下高斯的输入文件,只是定义了各个原子初始位置,有没有键都一样,只是高斯把原子之间力大的画了个键方便你理解罢了。
顺带一说,B3LYP算配合物键长会偏长较多。

发自小木虫Android客户端
6楼2015-12-05 12:26:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

sheep916628

新虫 (小有名气)

困扰了我快1礼拜了- -求帮助啊,各位
2楼2015-12-04 10:48:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sheep916628

新虫 (小有名气)

有人知道吗?
3楼2015-12-04 12:20:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sheep916628

新虫 (小有名气)

自己把它顶上去
4楼2015-12-04 14:53:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sheep916628

新虫 (小有名气)

自己顶上去
5楼2015-12-04 16:00:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

474029625

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sheep916628: 金币+5, 有帮助, 这个结构是肯定存在的,搭好模型后显示的也是电中性 2015-12-07 15:02:11
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-12 13:44:28
首先,请确认一下是不是Doublet,还有到底带不带电
其次,请至少使用6-31G(d),里面有Cu,不知道是不是应该用ECP
建议Calculate Force 取 Once,结构能够比较快的收敛。
最后,请务必确认结构的合理性合法性,如果在算一个没有意义的结构,结果是没有意义的。
7楼2015-12-07 10:20:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sheep916628

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 三方石墨 at 2015-12-05 12:26:04
没有问题,高斯默认:当键长较短时画做实键,高于一个设定值(常见中心离子配合物一般2埃多点)时,不显示键。
楼主可以回想一下高斯的输入文件,只是定义了各个原子初始位置,有没有键都一样,只是高斯把原子之间力 ...

这一般算配合物用什么参数?能否指教一下,谢谢了!
8楼2015-12-07 15:02:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

望念珊

新虫 (正式写手)

9楼2015-12-07 15:19:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三方石墨

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-12 13:44:34
引用回帖:
8楼: Originally posted by sheep916628 at 2015-12-07 15:02:51
这一般算配合物用什么参数?能否指教一下,谢谢了!...

我建议先用从头算,ccsd mp4,上大基组先试一下同中心离子,同配位原子的简单配合物,比如N就替换成NH3。键长心里大概有数(当然,考虑大基团对它的影响)。然后像TPSS,PW91,P86这类 文献常见的GGA都先上小基组试试,各个参数调一调再上大基组。最好别用Hybrid GGA,混合HF之后挺坑。

发自小木虫Android客户端
10楼2015-12-07 15:23:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 sheep916628 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料考研调剂 +9 Gs大王 2026-04-02 9/450 2026-04-02 10:24 by olim
[考研] 322求调剂 +5 熹僖XX 2026-03-31 6/300 2026-04-02 10:08 by 求调剂zz
[考研] 333求调剂 +3 12138。、m?x?b 2026-03-26 4/200 2026-04-02 09:58 by olim
[考研] 材料调剂 +12 一样YWY 2026-04-01 12/600 2026-04-02 09:15 by olim
[考博] 26年申博 +3 staryer 2026-03-30 4/200 2026-04-01 23:21 by ai4pharm
[考研] 材料调剂 +11 一样YWY 2026-03-31 11/550 2026-04-01 22:25 by zhouyuwinner
[考研] 江苏科技大学招材料研究生 +4 Su032713. 2026-04-01 5/250 2026-04-01 22:03 by cccchenso
[考研] 求调剂0703 +5 周嘉尧 2026-03-31 8/400 2026-04-01 20:32 by ltltkkk
[考研] 085600,320分求调剂 +5 大馋小子 2026-04-01 6/300 2026-04-01 19:40 by 唐沐儿
[考研] 英一数二生物信息学287分,本科生物科学,求调剂 +3 碧水xyz 2026-03-29 4/200 2026-04-01 15:35 by plum
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +7 hanamiko 2026-03-30 7/350 2026-04-01 13:22 by JourneyLucky
[考研] 0710生物学求调剂! +6 叙述文 2026-03-31 6/300 2026-04-01 09:39 by JourneyLucky
[考研] 0856调剂 +7 曲听筠 2026-03-30 7/350 2026-04-01 08:51 by JourneyLucky
[考研] 材料科学与工程求调剂 +13 深V宿舍吧 2026-03-29 13/650 2026-03-31 19:50 by Dyhoer
[考研] 学硕274求调剂 +17 Li李鱼 2026-03-26 17/850 2026-03-31 15:19 by 客尔美德
[考研] 322求调剂 +10 宋明欣 2026-03-27 10/500 2026-03-30 18:47 by 544594351
[考研] 334分 一志愿武理 材料求调剂 +16 李李不服输 2026-03-26 16/800 2026-03-30 17:47 by wangjy2002
[考研] 本科双非材料,跨考一志愿华电085801电气,283求调剂,任何专业都可以 +6 芝士雪baoo 2026-03-28 8/400 2026-03-29 08:16 by 松花缸1201
[考研] 一志愿上海理工能源动力(085800)310分求调剂 +3 zhangmingc 2026-03-27 4/200 2026-03-27 19:01 by 给你你注意休息
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +4 崔wj 2026-03-26 4/200 2026-03-27 08:04 by chemisry
信息提示
请填处理意见