| 查看: 4868 | 回复: 13 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
wyysunshine木虫 (知名作家)
|
[求助]
Modeltest寻找建树模型求助~~ 已有3人参与
|
|
|
正在做DNA序列分析，用到modeltest寻找建树模型，操作步骤如下：（参考http://blog.sina.com.cn/s/blog_43b74ed60100dexh.html） 1、把序列使用ClustalX 1.83进行比对，然后保存成PAUP识别的格式Nexus，然后导入至PAUP。 2、导入序列之后，在Modeltest的文件夹中，有一个paupblock的文件夹，里面有一个文件叫“modelblockPAUPb10”，然后在paup软件中，file，open，就可以执行这个命令了。就是paup用ML计算不同model下的似然值。如果序列比较多，且长的话，需要计算一阵呢！ 3、运行完这步之后，在paupblock文件夹中，会生成一个名为“model.scores”的文件。 4、安装MrMTgui，完成之后，打开界面，在下面会有MT path和PAUP path两个按钮，然后打开，找到Modeltest和paup所在的文件夹，双击他们的安装程序，就可以连接上两个软件了。 5、然后点击左边的按钮“select file”，找到“model.scores”，之后，点击按钮“Modeltest！！”，然后就会出现运行结果了。 6、会出现两个运行结果，一个是hLRT得出的结果，另一个是AIC给出的结果。 问题出在第5步，点击‘modeltest！！’之后，就出现了下面的提示，Execution of command ‘m.bat’ failed （error 2：the system cannot find the file specified.） 好像是说一个文件找不到，但我并没有改动文件夹里的东西啊，运行了好几次都是这样，不知道问题出在哪里  help me plz  modeltest.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
恩诺沙星（Enrofloxacin）科研解析：分子特征、LC-MS/MS 检测与实验室使用要点
已经有0人回复
-
Calderasib理化性质与实验操作技术笔记
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有256人回复
-
RMC-6291怎么用？RAS(ON) 三重复合物工具化合物的实验室实操要点
已经有0人回复
-
苯并呋咱全解析：NBD 荧光衍生化试剂母核的化学特性与实验室应用
已经有0人回复
-
生物质炭与活化剂氢氧化钾混合注意事项
已经有0人回复
-
科研人必读：新一代 KRAS G12C 抑制剂 Olomorasib 的研究进展
已经有0人回复
-
BT-11（Omilancor）研究化合物全解析：从分子结构到实验应用要点
已经有0人回复
-
富马酸贝达喹啉：二芳基喹啉类工具化合物的化学特征
已经有0人回复
-
BT投稿with editor状态快两周了，正常吗
已经有25人回复
-
Silevertinib（BDTX-1535）结构拆解：炔基双环片段为何成为合成瓶颈
已经有0人回复
wyysunshine
木虫 (知名作家)
- 应助: 34 (小学生)
- 金币: 1277.9
- 散金: 6905
- 红花: 32
- 帖子: 5027
- 在线: 510.6小时
- 虫号: 2525526
- 注册: 2013-06-29
- 专业: 植物遗传学
9楼2015-12-28 21:36:51
2楼2015-12-04 08:16:21
rommel1941
铁杆木虫 (正式写手)
情定山河
- MolEPI: 4
- 应助: 52 (初中生)
- 金币: 8144.7
- 散金: 269
- 红花: 6
- 帖子: 694
- 在线: 110.8小时
- 虫号: 67197
- 注册: 2005-05-05
- 性别: GG
- 专业: 分子与进化生态学
3楼2015-12-08 00:37:20
wyysunshine
木虫 (知名作家)
- 应助: 34 (小学生)
- 金币: 1277.9
- 散金: 6905
- 红花: 32
- 帖子: 5027
- 在线: 510.6小时
- 虫号: 2525526
- 注册: 2013-06-29
- 专业: 植物遗传学
4楼2015-12-18 20:14:13
