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wyysunshine木虫 (知名作家)
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Modeltest寻找建树模型求助~~ 已有3人参与
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正在做DNA序列分析，用到modeltest寻找建树模型，操作步骤如下：（参考http://blog.sina.com.cn/s/blog_43b74ed60100dexh.html） 1、把序列使用ClustalX 1.83进行比对，然后保存成PAUP识别的格式Nexus，然后导入至PAUP。 2、导入序列之后，在Modeltest的文件夹中，有一个paupblock的文件夹，里面有一个文件叫“modelblockPAUPb10”，然后在paup软件中，file，open，就可以执行这个命令了。就是paup用ML计算不同model下的似然值。如果序列比较多，且长的话，需要计算一阵呢！ 3、运行完这步之后，在paupblock文件夹中，会生成一个名为“model.scores”的文件。 4、安装MrMTgui，完成之后，打开界面，在下面会有MT path和PAUP path两个按钮，然后打开，找到Modeltest和paup所在的文件夹，双击他们的安装程序，就可以连接上两个软件了。 5、然后点击左边的按钮“select file”，找到“model.scores”，之后，点击按钮“Modeltest！！”，然后就会出现运行结果了。 6、会出现两个运行结果，一个是hLRT得出的结果，另一个是AIC给出的结果。 问题出在第5步，点击‘modeltest！！’之后，就出现了下面的提示，Execution of command ‘m.bat’ failed （error 2：the system cannot find the file specified.） 好像是说一个文件找不到，但我并没有改动文件夹里的东西啊，运行了好几次都是这样，不知道问题出在哪里  help me plz  modeltest.jpg |
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