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814257155新虫 (初入文坛)
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[求助]
麻烦哪位大神帮看一下这个引物设计行吗？已有1人参与
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请教各位大神，本人想做大白猪的催乳素受体基因PRLR的引物用来测序，,以前不是学这个专业的，也没用过primer5.0，网上自学了一下，通过软件的自动设计功能做出来的引物是PRLR上游：5' CATCAGGGTATTTACTATCAG 3' 下游: 5' GGGTTAAGAATTTCGACTA 3'。不知道是否能行，希望明白的大神帮忙看下，谢谢。 附：PRLR大白猪基因 1 gtgacctgca tctttccacc agttccaggg ccaaaaataa aaggatttga cacccatctg 61 ttggaggtaa gtgccagcag tggagaatgt actgtgactg gctgctctgt tagctttctc 121 gttatatacg tgcacacagt acccatcagt ttagcctggc cggctcagcc atcccatcct 181 cgaggaccag ctgtccctcc tgttcagcac gtgtgtttac agaaagatga gggcggcatc 241 agggtattta ctatcagata ctgagtgtca gaggacaatg aaagaaaacc aaaaaaatat 301 aggaaaattt gctatgttta gcaggtctgt ttataagcac agtcataaac atttcgtaca 361 aataatcaat tgagaaagag ggtgattttt tttgtttttt taattggccg catatggaag 421 ttcccaggct cggggtctga actgatgctg cagctgctga cctacgccac agctcacagc 481 aacagcagat ccttaagtca ctgagcgagg ccagggaatg aacccacatc ctcatggata 541 ctagtcgaaa ttcttaaccc actgagccac aatgggaact ctgagggtga atattctgat 601 gcatacaaaa gagggctctc ccaccagccc ctccatcatc ctttggtata aggtcccact 661 tgaatgttct gtacagaaga cacaggaaca gaatatcctg ttcctgctgc gatttctgct 721 cagtttgagt gcccagttga gactgattca gtacagcgga gctggcattt gccagggccc 781 atttagacac attcaagtgg gaattaaatg tgttttgaat gaaaagaagg attagaacat 841 tttcagtttc gctgcaggtg gaaatatata gtttcaattt gaccttcagc ttaacactga 901 tgtatagaaa agcaattacc tgcgcattat gtcacctgac ccagccacca tgaggtcaaa 961 aacacagtaa tgtgaaacgt gagtcccagg ggattggctt gactgcattc atgcagatgg 1021 caaatatgac ctgctccccc atctctagca cttaccttcg tagacccagc ataaacatct 1081 cagctaacta catgatttgt ttagctcaca atttcacctt gtagccaccg agacgtaatg 1141 atggaataac tgcttttttg agtctaaaaa aagaaaaagg aaaagttctg ggatttttaa 1201 ggacattacc tttaattctc aaaagaactt tcccagatgg gtatgacttt tcccatttta 1261 caaatagaga aactgaggat cacagaacag cttatccaaa gttacagatc ctttaataag 1321 tgatagagcc gagatttagg caacagtcct ggacctgagt cagaggatgg gggagaagag 1381 cgaaaagcag gaagaggggg catggggggg ggctgaagat taaatggagg aggaagcaga 1441 acaggagatg gagagaatat gggccgtagc ggggggactg tagggggagg aggggaaatg 1501 gagtgggagg agagaaagag taggatggga agagaaggga ggaggaggga gaggagaagg 1561 aaaagacaag aaccagctta ccacggccag actctagaaa gtagggcggg aggtcaggag 1621 gccagcaacc agatctcaga gtcagtgaat ccccaggtgc caagtgcacg catgaacact 1681 gccggtttag atgtttccca agcttgtctt attcaacagc catatttctg ttggatgtac 1741 atatactact tgcccactca actcatgctc attattgctt aaagaaagac taagtgaaaa 1801 atcatgaact gagaaatatt agctgagtag taagtagtgg gatgttagga agccgacagc 1861 tgtcttgcct tgtgtcttta acagaaaggc aagtccgaag agcttctgag cgccctggga 1921 tgccaagact tcccccccac ttccgactgc gaggacctgc tggtggagtt tttagaagtg 1981 ga |
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2楼2015-12-01 16:49:18
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晕死，你果然不懂的太多。 刚才看了下你的序列，你选的是一段基因组序列，里面大部分是内含子序列，你到底要做什么实验？扩出这个序列要干什么？如果要得到编码区全长，看这个链接http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001001868.1。如果要找该基因的基因组序列，看这个链接http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NW_003612397.1，该序列的编码区为： mRNA complement(join(335902..336924,338755..338824, 339335..339434,340689..340830,342988..343157, 348691..348860,351239..351371,354442..354511)) /gene="PRLR" 也就是说该基因有内含子。 如果还是不懂，建议问下周围有分子生物学基础的人，比这样快捷。 |
4楼2015-12-02 01:15:52
6楼2015-12-02 11:49:56