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柚小西

新虫 (初入文坛)

[求助] PDB上找到一个基因有氨基酸序列,可是在NCBI上却找不到对应的核苷酸序列。 已有1人参与

一年前找生物公司合成了一个α-amylase基因,可是这个基因在NCBI上只有氨基酸序列,没有核苷酸序列呢,好奇怪的,在毕赤酵母上表达,表达不出来,并且已经尝试了俩个载体了。然后还研三了呢。所以现在怀疑是基因本身并不完整, 缺失了ORF阅读框的一部分,请大神们帮帮我,是否能找到核苷酸序列呢。
这个酶的PDB编号是2AAA。NCBI上的链接是http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/2AAA_A。此酶本身有484个氨基酸残基,但是它的晶体结构只有476个残基,C-末端的残基丢失了。
新人金币少,请见谅。在线等,急。研三女含泪求助
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superharry

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 柚小西 at 2015-12-10 16:38:02
亲,请问你的第一条序列中,点进去标题是Aspergillus niger CBS 513.88 alpha-amylase A type-1/2 partial mRNA, 值得是不完整的mRNA吗?...

我也非常想知道这个问题,在NCBI上查到的mRNA 显示partial mRNA,不知道啥意思,我想克隆并表达这个基因,不知道如何得到全长?
8楼2016-10-02 20:19:46
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