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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 对接结果不能看配体结构的原因
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luckzhang

新虫 (初入文坛)

[求助] 对接结果不能看配体结构的原因 已有1人参与

请教各位：
       把自己画的分子结构（与原配体结构类似）对接，看对接结果时出现如图所示警告，点击"Molecule"看配体结构时，出现“Warning: Unable to identify molecule row number..."。请问是什么原因呀，如何处理呢，谢谢大家。

对接结果不能看配体结构的原因
3.png
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1楼 2015-11-30 20:02:34
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

wbingxin2012

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
luckzhang: 金币+20, ★★★很有帮助, 谢谢耐心解答 2015-12-05 09:08:26
改一下文件名称，换个软件默认存储路径重新算就没有问题了
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

luckzhang
3楼2015-12-03 09:04:11
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普通回帖

luckzhang

新虫 (初入文坛)
备注：我用的是SYBYL2.0软件，请大家帮帮忙，谢谢了
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2楼2015-12-01 18:39:34
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luckzhang

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
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4楼2015-12-03 12:25:52
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luckzhang

新虫 (初入文坛)
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5楼2015-12-03 12:29:16
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wbingxin2012

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by luckzhang at 2015-12-03 12:29:16
你指的是改配体的名称，还是Jobname的名称呀，谢谢...

配体名称
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6楼2015-12-03 12:34:47
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luckzhang

新虫 (初入文坛)
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7楼2015-12-03 12:44:59
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wbingxin2012

银虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by luckzhang at 2015-12-03 12:44:59
我把配体名称改了一下，也改了给文件夹，还是不行。你能具体说一下吗，配体名称用纯英文字母行吗。怎么换软件默认存储路径呢，谢谢...

名字是英文或者数字都可以但是不能有特殊符号，你的这个名字应该是用三方软件画分子结构的时候命名的，软件不认，在SYBYL改一下名字再重新做一下，修改存储路径在set--Dictionaries下
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8楼2015-12-03 13:03:02
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luckzhang

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by wbingxin2012 at 2015-12-03 13:03:02
名字是英文或者数字都可以但是不能有特殊符号，你的这个名字应该是用三方软件画分子结构的时候命名的，软件不认，在SYBYL改一下名字再重新做一下，修改存储路径在set--Dictionaries下...

我就在SYBYL上画的分子结构，也没用特殊符号命名。我的软件中没有set--Dictionaries这个文件夹，是因为我的软件是盗版的吗？
      你指的存储路径是一开始设定默认文件夹，点击Option>Set>Defaut Directory，然后任选一个文件夹吗。
      谢谢解答
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9楼2015-12-03 15:53:36
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wbingxin2012

银虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by luckzhang at 2015-12-03 15:53:36
我就在SYBYL上画的分子结构，也没用特殊符号命名。我的软件中没有set--Dictionaries这个文件夹，是因为我的软件是盗版的吗？
      你指的存储路径是一开始设定默认文件夹，点击Option>Set>Defaut Director ...

设置路径就是在这个地方，那几个单词我记错了。
如果是在SYBYL下话的分子，那我就不知道了
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10楼2015-12-04 09:47:05
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