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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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shmilying

兑换贵宾

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[交流] 真菌高通量测序为什么这么难? 已有8人参与

各位虫友,做过真菌高通量测序吗?就是ITS1或ITS2。。。怎么送公司测得这么慢,几次送样还是部分做不出来?大家遇到这样的问题没啊?为什么细菌送去多少成功多少?而真菌缺这么难?
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何处是我的岸
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张俊亚

版主

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不是测序难,应该是你提取的环境中真菌量少

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2楼2015-11-26 14:52:40
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zhangjingwjs

版主

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我也做真菌,你选的ITS12,我打算选18s或者ITS45,可以交流下如何选择引物吗,有什么好的文章求推荐

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3楼2015-11-26 14:52:58
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若无敌12138

管理员

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!


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我也怕真菌测不出来,持续关注中

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4楼2015-11-26 14:54:51
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shmilying

主管区长

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引用回帖:
2楼: Originally posted by 张俊亚 at 2015-11-25 18:52:40
不是测序难,应该是你提取的环境中真菌量少

DNA质检都很好,公司有的ITS1做出来,有的ITS2做出来,有的全做不出来,不知怎么回事?
何处是我的岸
5楼2015-11-26 15:08:25
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shmilying

管理员

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangjingwjs at 2015-11-25 18:52:58
我也做真菌,你选的ITS12,我打算选18s或者ITS45,可以交流下如何选择引物吗,有什么好的文章求推荐

ITS1-2还是主流方法啊,测序公司多选用这个;短序列
何处是我的岸
6楼2015-11-26 15:09:35
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shmilying

超级版主

引用回帖:
4楼: Originally posted by 若无敌12138 at 2015-11-25 18:54:51
我也怕真菌测不出来,持续关注中

7楼2015-11-26 15:11:06
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zhangjingwjs

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!


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引用回帖:
6楼: Originally posted by shmilying at 2015-11-26 15:09:35
ITS1-2还是主流方法啊,测序公司多选用这个;短序列...

18s呢?或者its45

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8楼2015-11-26 15:12:11
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小记

兑换贵宾

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

9楼2015-11-26 15:46:10
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biolinker

实习版主

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引用回帖:
5楼: Originally posted by shmilying at 2015-11-26 15:08:25
DNA质检都很好,公司有的ITS1做出来,有的ITS2做出来,有的全做不出来,不知怎么回事?...

DNA质检很好,不一定就代表里面真菌会有很多。这个主要还是看你的样本类型。
10楼2015-11-27 09:15:35
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