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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 真菌高通量测序为什么这么难？
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shmilying

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 真菌高通量测序为什么这么难？ 已有8人参与

各位虫友，做过真菌高通量测序吗？就是ITS1或ITS2。。。怎么送公司测得这么慢，几次送样还是部分做不出来?大家遇到这样的问题没啊？为什么细菌送去多少成功多少？而真菌缺这么难？
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何处是我的岸
1楼 2015-11-26 14:51:11
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张俊亚

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
不是测序难，应该是你提取的环境中真菌量少

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2楼2015-11-26 14:52:40
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zhangjingwjs

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我也做真菌，你选的ITS12，我打算选18s或者ITS45，可以交流下如何选择引物吗，有什么好的文章求推荐

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3楼2015-11-26 14:52:58
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若无敌12138

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我也怕真菌测不出来，持续关注中

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4楼2015-11-26 14:54:51
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shmilying

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 张俊亚 at 2015-11-25 18:52:40
不是测序难，应该是你提取的环境中真菌量少

DNA质检都很好，公司有的ITS1做出来，有的ITS2做出来，有的全做不出来，不知怎么回事？
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何处是我的岸
5楼2015-11-26 15:08:25
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shmilying

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangjingwjs at 2015-11-25 18:52:58
我也做真菌，你选的ITS12，我打算选18s或者ITS45，可以交流下如何选择引物吗，有什么好的文章求推荐

ITS1-2还是主流方法啊，测序公司多选用这个；短序列
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何处是我的岸
6楼2015-11-26 15:09:35
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shmilying

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 若无敌12138 at 2015-11-25 18:54:51
我也怕真菌测不出来，持续关注中

7楼2015-11-26 15:11:06
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zhangjingwjs

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by shmilying at 2015-11-26 15:09:35
ITS1-2还是主流方法啊，测序公司多选用这个；短序列...

18s呢？或者its45

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8楼2015-11-26 15:12:11
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小记

新虫 (初入文坛)
顶上
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9楼2015-11-26 15:46:10
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biolinker

金虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
5楼: Originally posted by shmilying at 2015-11-26 15:08:25
DNA质检都很好，公司有的ITS1做出来，有的ITS2做出来，有的全做不出来，不知怎么回事？...

DNA质检很好，不一定就代表里面真菌会有很多。这个主要还是看你的样本类型。
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10楼2015-11-27 09:15:35
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