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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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shmilying

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 真菌高通量测序为什么这么难?已有8人参与

各位虫友,做过真菌高通量测序吗?就是ITS1或ITS2。。。怎么送公司测得这么慢,几次送样还是部分做不出来?大家遇到这样的问题没啊?为什么细菌送去多少成功多少?而真菌缺这么难?
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何处是我的岸
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张俊亚

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不是测序难,应该是你提取的环境中真菌量少

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2楼2015-11-26 14:52:40
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zhangjingwjs

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我也做真菌,你选的ITS12,我打算选18s或者ITS45,可以交流下如何选择引物吗,有什么好的文章求推荐

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3楼2015-11-26 14:52:58
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若无敌12138

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我也怕真菌测不出来,持续关注中

发自小木虫Android客户端
4楼2015-11-26 14:54:51
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shmilying

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 张俊亚 at 2015-11-25 18:52:40
不是测序难,应该是你提取的环境中真菌量少

DNA质检都很好,公司有的ITS1做出来,有的ITS2做出来,有的全做不出来,不知怎么回事?
何处是我的岸
5楼2015-11-26 15:08:25
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shmilying

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangjingwjs at 2015-11-25 18:52:58
我也做真菌,你选的ITS12,我打算选18s或者ITS45,可以交流下如何选择引物吗,有什么好的文章求推荐

ITS1-2还是主流方法啊,测序公司多选用这个;短序列
何处是我的岸
6楼2015-11-26 15:09:35
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shmilying

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 若无敌12138 at 2015-11-25 18:54:51
我也怕真菌测不出来,持续关注中

7楼2015-11-26 15:11:06
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zhangjingwjs

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by shmilying at 2015-11-26 15:09:35
ITS1-2还是主流方法啊,测序公司多选用这个;短序列...

18s呢?或者its45

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8楼2015-11-26 15:12:11
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小记

新虫 (初入文坛)

9楼2015-11-26 15:46:10
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biolinker

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by shmilying at 2015-11-26 15:08:25
DNA质检都很好,公司有的ITS1做出来,有的ITS2做出来,有的全做不出来,不知怎么回事?...

DNA质检很好,不一定就代表里面真菌会有很多。这个主要还是看你的样本类型。
10楼2015-11-27 09:15:35
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