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生成氢键列表的lst文件中总是出现下图中的后缀是怎么回事呀??
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想通过lst文件后面的氢键列表列出晶体中所有氢键作用的距离和角度,结果lst文件的氢键信息总是出现下面的后缀d(4-H4_d),其他晶体的lst文件都不会有后缀d,我检查了一下是不是我的原子命名错误,发现原子名字命名里没有d,请问哪位高手知道怎么解决么? Hydrogen bonds with H..A < r(A) + 2.000 Angstroms and <DHA > 110 deg. D-H d(D-H) d(H..A) <DHA d(D..A) A O4-H4_d 0.820 1.895 168.55 2.703 O7_d [ x-1, y+1, z ] O5-H5_d 0.820 1.842 175.31 2.660 O2_d [ x+1, y+1, z ] N1-H1A_d 0.900 2.036 144.41 2.817 O8_d [ -x+2, y+1/2, -z+1 ] N1-H1B_d 0.900 1.861 168.90 2.750 O7_d [ x, y+1, z ] O6-H6A_d 0.800 2.171 142.97 2.850 O5_d [ -x+3, y-1/2, -z+2 ] O6-H6A_d 0.800 2.358 140.19 3.016 O6_d [ -x+3, y-1/2, -z+2 ] O3-H3_d 0.883 1.805 148.01 2.597 O2_d |
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