应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 求大神帮我分析一段序列是不是cDNA全长
51/1返回列表
查看: 1425  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

SonmB

新虫 (初入文坛)

[交流] 求大神帮我分析一段序列是不是cDNA全长 已有3人参与

AAAGATGGCAGCTGCGATTTTGTTATTTTGTTGTGACTGTTTTTTCTTTGAATCATTCAT
TTGTTGGTTAGTTACACGTGTAATGTTGAGGGGTAAAAGATATATGTAGAGGGGAACACG
TCATAGAAAGCAAGGAAATGGAAAATATTTCTTCTTCTCTCTCCGTCTTCTCCTGCAATC
TCTGTTTCTCCAATTAATTTCAATTCTTTTTGCGGGAGTCAGCACTTACTCGAAAAGTGT
AAATCTAGGATATAAACTCTGAGTTGCAGAGTTGTATCATGAAGCGTATATCATAGCAAA
CGAATGCTCCTCAATATTGTCGTAAATCTTCTCATCAATCGACTTGCATATGCAAATTAC
CTTATAGTCAGTACTTGTTGGATCAACTAATCCAAATCCAACATTAAAGGATATGCGTAA
CGTGGAAGACAAGGCTTCCATTTTGGAAGAACTTTATATTCTTTTTTCGCAAGGTTCCAT
AAAGTTATAAGAGTGTTGTTGCATACACAGAATATACCATCATAAGGACCCCAAACGATT
CCAGGTTTCGGCATACAGACATCTTCATACGATATATCTGTTAGTGTTCCGTCAGGGAAA
ACATTTATTATATGGTCTCGTCCACAATCGATAGTAAGATGAGTATTTTCATCATTATAG
TCTTTTAGGTGTTTGGAGATGAAATGAGGACTTTTTATTAAGGCACTCCAAGATTTACAA
ACACACCTCAATCGCATCAAAGATTTTATGGACAGTCTTGATAAAATTTCCATCCACACA
TCCTCGTGCATGACTATGCTGCAAGCATTTTTCGTCGGGGT
这是一段转录组的序列，中间有一段ORF，但是不知道怎样确定3‘和5’UTR是否完整。求大神指导分析方法
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2015-11-23 10:44:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

XuanyuanLand

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by SonmB at 2015-11-23 20:28:27
确实是转录组的数据，不知道哪里不正确，希望能多多指教。实验新手，这些基本的知识还不太懂...

其实仅从序列很难看出是不是完整，建议还是找找相关EST序列，拼成转录本，再比较

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
9楼2015-11-23 21:46:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

XuanyuanLand

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
第一个不是G，5'-UTR不完整，完毕。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2015-11-23 10:54:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

SonmB

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by XuanyuanLand at 2015-11-23 10:54:05
第一个不是G，5'-UTR不完整，完毕。

额，我是想知道怎么分析的，可不可以帮我解释一下。谢谢
赞一下 回复此楼
3楼2015-11-23 11:51:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

XuanyuanLand

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
因为转录本第一个5'的帽子是在第一个G上加的甲基啊，其他我就不知道了

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2015-11-23 11:53:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 yPv6ndDtiRxQ 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:15 by CLKTSgjM0Uqj
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-11 16:57 by Ai19911123
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊 +7 Tide man 2026-08-10 8/400 2026-08-11 15:49 by 铁帽子农民
[论文投稿] 职称评审，求友友推荐见刊最快的期刊 +3 工厂打螺丝 2026-08-08 3/150 2026-08-11 13:42 by 会议编辑
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] 帮忙看看fileCode +6 wwncly 2026-08-10 12/600 2026-08-11 13:01 by wwncly
[基金申请] filecode +9 documentary 2026-08-10 9/450 2026-08-11 10:08 by wk7465
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] 确定了，国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] fileCode有新解读？ +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变，有变的大神么？ +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了，今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 好消息？这个有何含义？？？ +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭