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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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SonmB

新虫 (初入文坛)

[交流] 求大神帮我分析一段序列是不是cDNA全长 已有3人参与

AAAGATGGCAGCTGCGATTTTGTTATTTTGTTGTGACTGTTTTTTCTTTGAATCATTCAT
TTGTTGGTTAGTTACACGTGTAATGTTGAGGGGTAAAAGATATATGTAGAGGGGAACACG
TCATAGAAAGCAAGGAAATGGAAAATATTTCTTCTTCTCTCTCCGTCTTCTCCTGCAATC
TCTGTTTCTCCAATTAATTTCAATTCTTTTTGCGGGAGTCAGCACTTACTCGAAAAGTGT
AAATCTAGGATATAAACTCTGAGTTGCAGAGTTGTATCATGAAGCGTATATCATAGCAAA
CGAATGCTCCTCAATATTGTCGTAAATCTTCTCATCAATCGACTTGCATATGCAAATTAC
CTTATAGTCAGTACTTGTTGGATCAACTAATCCAAATCCAACATTAAAGGATATGCGTAA
CGTGGAAGACAAGGCTTCCATTTTGGAAGAACTTTATATTCTTTTTTCGCAAGGTTCCAT
AAAGTTATAAGAGTGTTGTTGCATACACAGAATATACCATCATAAGGACCCCAAACGATT
CCAGGTTTCGGCATACAGACATCTTCATACGATATATCTGTTAGTGTTCCGTCAGGGAAA
ACATTTATTATATGGTCTCGTCCACAATCGATAGTAAGATGAGTATTTTCATCATTATAG
TCTTTTAGGTGTTTGGAGATGAAATGAGGACTTTTTATTAAGGCACTCCAAGATTTACAA
ACACACCTCAATCGCATCAAAGATTTTATGGACAGTCTTGATAAAATTTCCATCCACACA
TCCTCGTGCATGACTATGCTGCAAGCATTTTTCGTCGGGGT
这是一段转录组的序列，中间有一段ORF，但是不知道怎样确定3‘和5’UTR是否完整。求大神指导分析方法
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1楼 2015-11-23 10:44:52
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XuanyuanLand

银虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
8楼: Originally posted by SonmB at 2015-11-23 20:28:27
确实是转录组的数据，不知道哪里不正确，希望能多多指教。实验新手，这些基本的知识还不太懂...

其实仅从序列很难看出是不是完整，建议还是找找相关EST序列，拼成转录本，再比较

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9楼2015-11-23 21:46:29
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XuanyuanLand

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
第一个不是G，5'-UTR不完整，完毕。

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2楼2015-11-23 10:54:05
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SonmB

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by XuanyuanLand at 2015-11-23 10:54:05
第一个不是G，5'-UTR不完整，完毕。

额，我是想知道怎么分析的，可不可以帮我解释一下。谢谢
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3楼2015-11-23 11:51:17
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XuanyuanLand

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
因为转录本第一个5'的帽子是在第一个G上加的甲基啊，其他我就不知道了

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4楼2015-11-23 11:53:32
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