24小时热门版块排行榜    

查看: 4933  |  回复: 10
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

gaohongmei128

金虫 (小有名气)

[交流] [求助]在ChemDraw中绘制的大分子,如何转化成能直接导入Gaussian计算的格式

请教各位好心人,指点一下:


在ChemDraw中绘制的大分子,如何转化成能直接导入Gaussian计算的文件格式。
  
   谢谢啦,谢谢抽出宝贵时间指点一下,万分的感激!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nxf_2008

木虫 (正式写手)

你先用chemdraw画出分子保存为xx.cdx,在chem3D中预优化一下得到最低能量稳定构型在保存为xx.gjc,用记事本打开,把坐标复制到gjf文件中,然后在gaussian中在优化就可以了
天高任鸟飞,海阔凭鱼跃!
9楼2008-09-26 14:54:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

zyy816

至尊木虫 (著名写手)


jghe(金币+1,VIP+0):谢谢参与讨论!
先导入到chem3d,然后再保存为gjf格式,应该是可以的,但是,你在chem3d里面检验立体结构是否正确
2楼2008-09-15 17:38:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yeziwon

铜虫 (初入文坛)

★ ★
灯塔守望者(金币+2,VIP+0):谢谢支持小木虫
先导入到chem3d,然后再保存为gjf格式,我刚刚试了,出现的是乱码,貌似不行。
不过可以先用chem3d构建正确的立体结构,然后点击标题栏中的View,找到Cartesian Table 或者 Z-Matrix table 复制下直角坐标或者内坐标,打开
gaussian建立一个新的.gjf文件,将刚才复制下的坐标稍作修改(去掉数据中出现的括号),加上命令,就可进行高斯的运算。
If you believe it, you can achieve it.
3楼2008-09-19 13:15:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaohongmei128

金虫 (小有名气)

谢谢一楼和二楼的同道人,谢谢谢谢!
4楼2008-09-19 18:45:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学调剂 ,六级已过,有科研经历 +12 曦熙兮 2026-03-15 12/600 2026-03-19 19:42 by maocaozhuxi
[考博] 东华理工大学化材专业26届硕士博士申请 +8 zlingli 2026-03-13 8/400 2026-03-19 16:32 by 轻松不少随
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +4 脱颖而出 2026-03-16 12/600 2026-03-19 16:17 by 脱颖而出
[考研] 271材料工程求调剂 +6 .6lL 2026-03-18 6/300 2026-03-19 15:41 by haoshis
[考研] 一志愿北京化工大学0703化学318分,有科研经历,求调剂 +3 一瓶苯甲酸 2026-03-14 3/150 2026-03-19 15:17 by 尽舜尧1
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +17 不知道叫什么! 2026-03-15 19/950 2026-03-19 15:06 by 尽舜尧1
[考研] 化学求调剂 +3 临泽境llllll 2026-03-17 4/200 2026-03-19 13:59 by houyaoxu
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +4 生物工程调剂 2026-03-16 12/600 2026-03-19 11:10 by 生物工程调剂
[考研] 本科郑州大学物理学院,一志愿华科070200学硕,346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
[考研] 085410人工智能专硕317求调剂(0854都可以) +3 xbxudjdn 2026-03-18 3/150 2026-03-18 22:14 by zhq0425
[考研] 材料,纺织,生物(0856、0710),化学招生啦 +3 Eember. 2026-03-17 9/450 2026-03-18 10:28 by Eember.
[考研] 268求调剂 +6 简单点0 2026-03-17 6/300 2026-03-18 09:04 by 无际的草原
[考研] 293求调剂 +11 zjl的号 2026-03-16 16/800 2026-03-18 08:10 by zhukairuo
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
[考研] 材料与化工专硕调剂 +5 heming3743 2026-03-16 5/250 2026-03-17 14:03 by 勇敢太监王公公
[考博] 26申博 +4 八6八68 2026-03-16 4/200 2026-03-17 13:00 by 轻松不少随
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[论文投稿] 有没有大佬发小论文能带我个二作 +3 增锐漏人 2026-03-17 4/200 2026-03-17 09:26 by xs74101122
[考研] 304求调剂 +3 曼殊2266 2026-03-14 3/150 2026-03-16 16:39 by houyaoxu
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
信息提示
请填处理意见