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zyjwl2004

木虫 (正式写手)

[交流] PCR无法扩增出产物

如题,我扩了很多次,也尝试了很多条件,都扩不出来,不知道是那里出问题了。引物应该是没有什么问题的,有上海生工合成的,电泳后有引物二聚体。模板DNA也没有什么问题,电泳时质粒有三条带。其他的dNTP和Tag酶是宝生的,问题就是怎么扩都扩不出来,急啊请教各位,我该怎么办?谢谢
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★ ★
reasonspare(金币+3,VIP+0):thx
片段多长?一般聚合时间以1min/kb算
以质粒为模板,变性时间最好长一些,预变性最好能有94℃,10min
片段越长,GC比越大,预变性的时间也应该相应变长
目的片段的GC比大(65%甚至更高)的话,可以尝试用high GC buffer
或者自己手工加DMSO等增强剂
但DMSO浓度过高也可能会抑制Taq酶的作用,所以自己要摸个梯度
另外,如果用高保真酶,效率会比普通重组Taq酶低,应该延长聚合时间

由于你提供的信息量比较少,所以只能给这么多建议
2楼2008-09-13 09:43:25
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yylee

铁虫 (初入文坛)


reasonspare(金币+1,VIP+0):thx
实在不行就要考虑下引物的问题,换个公司合成一次引物看看,生工的引物... ...
3楼2008-09-13 10:27:54
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lifei-fei

金虫 (著名写手)

伊丽莎白


reasonspare(金币+1,VIP+0):thx
恩!模板浓度太大,也扩增不出!
做有意义的事就是好好活着!
4楼2008-09-13 13:05:47
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victorhan

木虫 (正式写手)


reasonspare(金币+1,VIP+0):thx
阳性对照有没有条带啊,PCR实验有时候很怪,每次均需设置阳性\阴性\空白对照方可进一步分析
有梦谁都了不起,有勇气就会有奇迹!
5楼2008-09-13 14:21:54
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greenspringmi

银虫 (正式写手)

★ ★ ★
reasonspare(金币+3,VIP+0):thx
做PCR时可以做的有:退火温度梯度、模板浓度梯度、引物浓度梯度;
这三种因素对结果的影响依次减低;
如果还是扩增不出来,建议重新设计引物。
你的PCR检测有引物二聚体,估计是引物本身的原因。
6楼2008-09-13 22:19:42
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足下客

木虫 (正式写手)

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):thx
我跟楼主碰到过相同的问题,但不知楼主所要扩的基因片段是多大的?
我扩一个2.8KB的片段,花了我一个多月的时间才摸清条件。
如果片段长度大,建议你使用LA taq酶 和2*GC buffer I 或2*GC buffer II,首选第一种buffer。如果片段长度不大,可以试一下2*taq mix
可能你的退火温度选的也不合适,请问你的GC百分比是多少?

PS:我用的引物都是Invitrogen合成的,从来没出过问题  出现引物二聚体是很正常的,可以用Primer5给你的引物打一下分,一般要在五十分以上才能比较容易地扩出

[ Last edited by 足下客 on 2008-9-14 at 13:21 ]
7楼2008-09-14 13:18:04
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zyjwl2004

木虫 (正式写手)

谢谢各位的恶意见了,我再摸下情况试下,再次谢谢
8楼2008-09-15 10:16:54
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shuhua759

捐助贵宾 (著名写手)

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):thx
换同一个公司的引物,酶,DNTPS,BUFFER试试,我还遇到过不同的公司的试剂混用就P不出来的情况
9楼2008-09-16 12:22:04
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吟啸徐行

银虫 (小有名气)

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):thx
DNA为模板扩增挺不好扩的,给你几个建议:1、稍微增加模板量 2、做个梯度PCR摸索合适的退火温度 3、延伸的温度要把握好 4、增加循环数
10楼2008-09-16 18:08:58
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