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hunger1569

铜虫 (初入文坛)

[求助] 运行autodoack grid以后出错,怎么办?急已有1人参与

运行autodoack grid以后出错:can't find or open recptor PDBQT file "rigid.pdbqt",意思是找不到或打不开受体文件,怎么回事?也把路径设置在同一个文件夹了,是不是受体文件设置不对吗?那受体文件如何准备啊?

受体准备是按照以下方法准备的:File>ReadMolecule:打开一个对话窗,导入PDB 文件。Edit>Delete:删除整个分子、选择的原子或者氢原子。Edit>Hydrogens>Add:使用Babel 添加所有或者极性氢原子。Edit>Charges:使用Babel 计算任意分子的Gasteiger 电荷

运行autodoack grid以后出错,怎么办?急
360截图20151110165030666.jpg
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hunger1569

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by pymol at 2015-11-21 14:31:03
路径中确保没有中文字符及特殊字符...

谢谢应助,已经解决了
5楼2015-11-24 21:41:01
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白鸿明

木虫 (正式写手)

win下运行么?
两个msi文件制定路径了吗?

发自小木虫IOS客户端
2楼2015-11-11 00:23:24
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hunger1569

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 白鸿明 at 2015-11-11 00:23:24
win下运行么?
两个msi文件制定路径了吗?

在win7下运行
文件都有路径,但是不知道哪里出错了
3楼2015-11-19 11:36:16
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)


【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by hunger1569 at 2015-11-19 11:36:16
在win7下运行
文件都有路径,但是不知道哪里出错了...

路径中确保没有中文字符及特殊字符
4楼2015-11-21 14:31:03
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