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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 运行autodoack grid以后出错,怎么办？急
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hunger1569

铜虫 (初入文坛)

[求助] 运行autodoack grid以后出错,怎么办？急 已有1人参与

运行autodoack grid以后出错：can't find or open recptor PDBQT file "rigid.pdbqt"，意思是找不到或打不开受体文件，怎么回事？也把路径设置在同一个文件夹了，是不是受体文件设置不对吗？那受体文件如何准备啊？

受体准备是按照以下方法准备的:File>ReadMolecule：打开一个对话窗，导入PDB 文件。Edit>Delete：删除整个分子、选择的原子或者氢原子。Edit>Hydrogens>Add：使用Babel 添加所有或者极性氢原子。Edit>Charges:使用Babel 计算任意分子的Gasteiger 电荷

运行autodoack grid以后出错,怎么办？急
360截图20151110165030666.jpg
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1楼 2015-11-10 19:34:47
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白鸿明

木虫 (正式写手)
win下运行么？
两个msi文件制定路径了吗？

发自小木虫IOS客户端
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2楼2015-11-11 00:23:24
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hunger1569

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 白鸿明 at 2015-11-11 00:23:24
win下运行么？
两个msi文件制定路径了吗？

在win7下运行
文件都有路径，但是不知道哪里出错了
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3楼2015-11-19 11:36:16
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by hunger1569 at 2015-11-19 11:36:16
在win7下运行
文件都有路径，但是不知道哪里出错了...

路径中确保没有中文字符及特殊字符
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4楼2015-11-21 14:31:03
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hunger1569

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by pymol at 2015-11-21 14:31:03
路径中确保没有中文字符及特殊字符...

谢谢应助，已经解决了
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5楼2015-11-24 21:41:01
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593689652

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by hunger1569 at 2015-11-24 21:41:01
谢谢应助，已经解决了...

您好！请问您是怎么解决的？可以教教我吗？我也碰到这个问题纠结快一个月了

发自小木虫Android客户端
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6楼2015-12-29 00:01:01
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baby54321

新虫 (小有名气)
您好！我也碰到这个问题，快一个礼拜了没弄明白哪里出错。请问您是怎么解决的?
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7楼2016-05-09 17:50:24
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