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ailsaZT

新虫 (初入文坛)

[求助] 有关DNAMAN的基础问题,希望大家帮帮我! 已有7人参与

各位路过的好心人看一看,作为误入生命科学行业的一员,各种苦涩不多言,但是还是希望坚持把自己选择的路好好走下去。希望大家帮我解答一下关于DNAMAN的一些小疑惑:
如图
在序列比对中,会出现某一对碱基对不上,或者是一个点和一个碱基对不上,这二者有什么区别?
序列比对一般看的是什么?比成什么样子算是成功了?(我现在在做扩基因,连载体的实验,想证明把目的片段连到载体上了)

谢谢大家!我真的很需要帮助,我没什么金币,还有好多问题要问,所以只能给这么多了(我已经被师姐嫌弃了,自己上网查又看不懂,但我知道只有弄懂第一次,才有信心继续追赶被别人拉下的距离!

有关DNAMAN的基础问题,希望大家帮帮我!
2.PNG
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Esther_zhang

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-11-05 18:35:14
前面是碱基不一样,后面一个点,表示你的序列这个位置没有该碱基。
7楼2015-11-05 17:03:37
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陈爱中

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-11-05 18:35:46
碱基不一致表示你测序的样品有突变,空格的地方表示你测序样品有缺失或者插入

发自小木虫IOS客户端
2楼2015-11-05 11:50:52
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ailsaZT

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 陈爱中 at 2015-11-05 11:50:52
碱基不一致表示你测序的样品有突变,空格的地方表示你测序样品有缺失或者插入

先谢谢你的回复不过我还有疑问,为什么多序列比对的时候不一定是从头开始比,有时候会是从中间或者其他地方比呢?你对DNAMAN软件熟悉么?因为我还有很多基础问题不是特别理解
3楼2015-11-05 13:23:06
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陈爱中

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by ailsaZT at 2015-11-05 13:23:06
先谢谢你的回复不过我还有疑问,为什么多序列比对的时候不一定是从头开始比,有时候会是从中间或者其他地方比呢?你对DNAMAN软件熟悉么?因为我还有很多基础问题不是特别理解...

测序公司给你的测序结果,头和尾都有两三百bp不可信的,所以不从头比对。

发自小木虫IOS客户端
4楼2015-11-05 13:25:26
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