24小时热门版块排行榜    

查看: 3329  |  回复: 16
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

ailsaZT

新虫 (初入文坛)

[求助] 有关DNAMAN的基础问题,希望大家帮帮我! 已有7人参与

各位路过的好心人看一看,作为误入生命科学行业的一员,各种苦涩不多言,但是还是希望坚持把自己选择的路好好走下去。希望大家帮我解答一下关于DNAMAN的一些小疑惑:
如图
在序列比对中,会出现某一对碱基对不上,或者是一个点和一个碱基对不上,这二者有什么区别?
序列比对一般看的是什么?比成什么样子算是成功了?(我现在在做扩基因,连载体的实验,想证明把目的片段连到载体上了)

谢谢大家!我真的很需要帮助,我没什么金币,还有好多问题要问,所以只能给这么多了(我已经被师姐嫌弃了,自己上网查又看不懂,但我知道只有弄懂第一次,才有信心继续追赶被别人拉下的距离!

有关DNAMAN的基础问题,希望大家帮帮我!
2.PNG
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ailsaZT

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 陈爱中 at 2015-11-05 11:50:52
碱基不一致表示你测序的样品有突变,空格的地方表示你测序样品有缺失或者插入

先谢谢你的回复不过我还有疑问,为什么多序列比对的时候不一定是从头开始比,有时候会是从中间或者其他地方比呢?你对DNAMAN软件熟悉么?因为我还有很多基础问题不是特别理解
3楼2015-11-05 13:23:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

陈爱中

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-11-05 18:35:46
碱基不一致表示你测序的样品有突变,空格的地方表示你测序样品有缺失或者插入

发自小木虫IOS客户端
2楼2015-11-05 11:50:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

陈爱中

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by ailsaZT at 2015-11-05 13:23:06
先谢谢你的回复不过我还有疑问,为什么多序列比对的时候不一定是从头开始比,有时候会是从中间或者其他地方比呢?你对DNAMAN软件熟悉么?因为我还有很多基础问题不是特别理解...

测序公司给你的测序结果,头和尾都有两三百bp不可信的,所以不从头比对。

发自小木虫IOS客户端
4楼2015-11-05 13:25:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-11-05 18:35:32
ailsaZT: 金币+1, 有帮助 2015-11-10 15:53:41
红圈圈出的上下不一致的地方就是你的测序结果与你原序列不一致的地方,从你比对结果看,有很多位点与原序列有差异,这个要根据具体情况看,建议使用高保真酶扩增。
5楼2015-11-05 13:27:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +19 Lanmanbaby 2026-08-09 32/1600 2026-08-12 09:56 by gltch
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +5 Tide man 2026-08-11 5/250 2026-08-12 09:24 by kangban
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +8 Tide man 2026-08-10 9/450 2026-08-11 20:39 by beefly
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
信息提示
请填处理意见