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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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何婧芳

新虫 (初入文坛)

[求助] 使用DS进行分子力学模拟 已有1人参与

我是先使用DS构建蛋白的3D结构，然后想要模拟不同pH条件下蛋白表面电荷分布，但是加上pH优化这个条件以后，进行SD优化的结构是一样的，按理说应该是不一样的，所以我不知道问题出在哪里来的，急，求大神帮忙
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1楼 2015-11-05 09:46:39
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awaken2013

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

用H++服务器 计算一下就好。
我见过有篇硕士论文也是做这个的。



但是不同条件下的pH 你想模拟些什么呢？
确定能用MD观察和分析到么？这应该是该考虑的问题
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2楼2015-11-09 02:23:14
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何婧芳

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by awaken2013 at 2015-11-09 02:23:14
用H++服务器 计算一下就好。
我见过有篇硕士论文也是做这个的。



但是不同条件下的pH 你想模拟些什么呢？
确定能用MD观察和分析到么？这应该是该考虑的问题

我是初学，H++是什么啊，我想模拟不同PH下表面电荷分布，如果第一步优化就一样的，后面就都一样
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3楼2015-11-09 10:31:55
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