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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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何婧芳

新虫 (初入文坛)

[求助] 使用DS进行分子力学模拟 已有1人参与

我是先使用DS构建蛋白的3D结构,然后想要模拟不同pH条件下蛋白表面电荷分布,但是加上pH优化这个条件以后,进行SD优化的结构是一样的,按理说应该是不一样的,所以我不知道问题出在哪里来的,急,求大神帮忙
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awaken2013

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

用H++服务器 计算一下就好。
我见过有篇硕士论文也是做这个的。



但是不同条件下的pH 你想模拟些什么呢?
确定能用MD观察和分析到么?这应该是该考虑的问题
2楼2015-11-09 02:23:14
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何婧芳

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by awaken2013 at 2015-11-09 02:23:14
用H++服务器 计算一下就好。
我见过有篇硕士论文也是做这个的。



但是不同条件下的pH 你想模拟些什么呢?
确定能用MD观察和分析到么?这应该是该考虑的问题

我是初学,H++是什么啊,我想模拟不同PH下表面电荷分布,如果第一步优化就一样的,后面就都一样
3楼2015-11-09 10:31:55
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