24小时热门版块排行榜    

查看: 3969  |  回复: 6

kangaroo0513

新虫 (正式写手)

[求助] BiFC或者splitGFP的融合蛋白linker怎么选择? 已有2人参与

话说,看了别人的文献,再使用splitGFP或者BiFC的时候,也没有太具体说怎么设计linker。。有没有有经验的大虾,指点一下,我的目的基因和半个荧光团之间的linker怎么设计比较好?另外,荧光团应该放在N端还是C端(有莫有影响)?

倒是看见一篇文献,用的splitGFP,把GFP掰成了3份,其中1份弥散表达,2份做融合蛋白,此时他用的linker是30aa的柔性linker。因此有以上问题。额外的,是不是长一些的柔性linker连接就不必纠结连在N端还是C端?但是长一些的linker会不会造成本来相距较远的两个分子出现假阳性?

我的目的蛋白一个1300bp(52kd)一个500bp(19kd)左右。。。哪位神仙狂指点me吧。。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kangaroo0513: 金币+8, ★★★很有帮助 2015-11-05 13:18:23
我们用的是富含甘氨酸的linker GGSGGGSG
N端或C端会有影响,这与linker长短不直接相关,应当根据你的目的蛋白具体性质判断。
植物生理群69993869,为避免广告,申请加入请提供木虫昵称,院校及专业信息
2楼2015-11-04 22:49:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

siriusxuan

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kangaroo0513: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-11-05 13:19:06
GGGGS 重复一两次,三次也行
此座可言轻社稷,江山万里起风尘。
3楼2015-11-04 23:52:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kangaroo0513

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by starseacow at 2015-11-04 22:49:36
我们用的是富含甘氨酸的linker GGSGGGSG
N端或C端会有影响,这与linker长短不直接相关,应当根据你的目的蛋白具体性质判断。

能具体说下如何通过蛋白的具体性质判断linker放在哪端么?
4楼2015-11-05 13:18:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kangaroo0513

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by siriusxuan at 2015-11-04 23:52:08
GGGGS 重复一两次,三次也行

N端融合或者C端融合有虾米影响?某一端可能会失败?
5楼2015-11-05 13:59:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冷月依依

新虫 (小有名气)

理论上没有影响或很小,可以同时构建N和C端的载体一起进行

发自小木虫Android客户端
6楼2016-01-30 00:54:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by kangaroo0513 at 2015-11-05 13:18:54
能具体说下如何通过蛋白的具体性质判断linker放在哪端么?...

这得具体问题具体分析,举例来说蛋白A是膜蛋白,C端跨膜,那么把GFP连在C端可能就有问题,会看不到信号。
植物生理群69993869,为避免广告,申请加入请提供木虫昵称,院校及专业信息
7楼2016-01-30 21:54:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 kangaroo0513 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 BCdvBAEpt3zm 2026-11-01 4/200 2026-11-02 10:23 by dcc2yOIRGGTT
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 7/350 2026-11-02 09:29 by dcc2yOIRGGTT
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 9/450 2026-11-02 06:13 by xzcv0Tehd8lQ
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 13/650 2026-11-02 06:03 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 10/500 2026-11-02 06:00 by xzcv0Tehd8lQ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 11/550 2026-11-02 06:00 by xzcv0Tehd8lQ
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 21/1050 2026-11-02 05:41 by xzcv0Tehd8lQ
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 18/900 2026-11-02 05:37 by xzcv0Tehd8lQ
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 22:27 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 22:11 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 21:45 by xzcv0Tehd8lQ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 11/550 2026-11-01 21:35 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 20:03 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 16:48 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 12:40 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-01 12:38 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 10/500 2026-11-01 12:27 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 12:14 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 18/900 2026-11-01 12:11 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 申博自荐 2篇一区TOP+1篇EI+2公开发明专利 2027博士申请 +3 小小阿光 2026-10-27 3/150 2026-10-29 23:56 by 起风了的快乐
信息提示
请填处理意见