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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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liuyanyanhx

新虫 (小有名气)

[交流] Sybyl做对接时,是否需要天然晶体结构中的配体与此配体对接后的位置完全重合?

sybyl所做对接后,如果想证明对接方法准确性,是否需要把天然配体对接进去以后的位置,与在晶体结构PDB中的位置完全重合,才能说明此对接方法可信?大家所认同的对接结构与晶体结构叠合后的RMSD值是否必须几近零才可以接受此对接方法?我附件中是天然结构中的配体与对接后的配体的叠合图,大家觉得这样的结果是否可以说明对接已经重现晶体结构?

Sybyl做对接时,是否需要天然晶体结构中的配体与此配体对接后的位置完全重合?
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zwn400

金虫 (小有名气)

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liuyanyanhx: 金币+1 2015-11-03 08:36:27
用DS对接不方便些?

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3楼2015-11-02 22:06:43
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liuyanyanhx

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zwn400 at 2015-11-02 22:06:43
用DS对接不方便些?

现在已经用sybyl做了系列对接,所以有这个疑问,以验证所做对接是否合理。
8楼2015-11-03 08:36:21
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zwn400

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
liuyanyanhx: 金币+1 2015-11-04 11:15:19
用薛定谔或GOLD对接好些

发自小木虫Android客户端
9楼2015-11-03 11:34:09
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