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我对接的配体是个有机盐，该如何使分子带电荷与蛋白对接呢？
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大神好！最近在做有机盐与蛋白的对接。我的配体在ligand >input前都是个盐，但是output之后，文件在ds中只显示了有机部分，而且N不再带正电荷。听说不能直接拿这个结构和蛋白对接，可是我该如何使这个配体带电荷与蛋白对接呢？不知道说清楚了，还望明白的大神给指点下！谢谢啦！ ligand>input.jpg  ligand>output.jpg |
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