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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】优化结构计算时间太长怎么办？
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zhangdi6802

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】优化结构计算时间太长怎么办？

请教高手：我的这个物质分子量在200多，在Gview中画出图形后，直接进行优化计算，DFT/RB3LYP 6-31G+,进行的，算了十几个小时了，没有出结果，但也没有结果有死机，依然显示processing , 请问这正常吗，我的机器是cpu奔四 3.0G主频 内存2.0G  ，有没有更快的方法呢？ 谢谢，十分着急！！

[ Last edited by lei0736 on 2008-9-11 at 11:31 ]
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亮剑精神
1楼 2008-09-10 14:35:47
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
引用回帖:
Originally posted by hora0212 at 2008-9-10 15:58:
按照我的经验,你的机器想把这个分子量奔下来,我估计一个月都不够
我这边有个4核的小服务器在算,超过80多个就不好优化了
时间都好几天
建议你撤了吧

楼主说分子量是200多，那么原子数也就几十个，还是能算动的，只不过在windows下计算的确是慢了点，
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
5楼2008-09-11 20:21:52
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hora0212

铜虫 (初入文坛)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
按照我的经验,你的机器想把这个分子量奔下来,我估计一个月都不够
我这边有个4核的小服务器在算,超过80多个就不好优化了
时间都好几天
建议你撤了吧
赞一下(10人) 回复此楼
2楼2008-09-10 15:58:08
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sandycug

金虫 (小有名气)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
将对称性调整一下，通常因为对称性太差导致计算很难收敛
或者先用分子动力学方法优化一下

或者换GGA优化一下

[ Last edited by sandycug on 2008-9-10 at 17:50 ]
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3楼2008-09-10 17:49:37
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alick1102

铜虫 (小有名气)
★
jghe(金币+1,VIP+0):谢谢参与讨论！
引用回帖:
Originally posted by sandycug at 2008-9-10 17:49:
将对称性调整一下，通常因为对称性太差导致计算很难收敛
或者先用分子动力学方法优化一下

或者换GGA优化一下

[ Last edited by sandycug on 2008-9-10 at 17:50 ]

GGA与收敛快慢关系不大，关键是你的初始构型。
不是分子动力学（molecular dynamics）优化，而是分子力学(Molecular mechanics)。这两者差别蛮大的：）
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到了博士的时候才知道，科学也不过是为了吃饭的。
4楼2008-09-10 18:33:49
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