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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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zhangdi6802

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】优化结构计算时间太长怎么办？

请教高手：我的这个物质分子量在200多，在Gview中画出图形后，直接进行优化计算，DFT/RB3LYP 6-31G+,进行的，算了十几个小时了，没有出结果，但也没有结果有死机，依然显示processing , 请问这正常吗，我的机器是cpu奔四 3.0G主频 内存2.0G  ，有没有更快的方法呢？ 谢谢，十分着急！！

[ Last edited by lei0736 on 2008-9-11 at 11:31 ]
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亮剑精神
1楼 2008-09-10 14:35:47
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hora0212

铜虫 (初入文坛)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
按照我的经验,你的机器想把这个分子量奔下来,我估计一个月都不够
我这边有个4核的小服务器在算,超过80多个就不好优化了
时间都好几天
建议你撤了吧
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2楼2008-09-10 15:58:08
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sandycug

金虫 (小有名气)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
将对称性调整一下，通常因为对称性太差导致计算很难收敛
或者先用分子动力学方法优化一下

或者换GGA优化一下

[ Last edited by sandycug on 2008-9-10 at 17:50 ]
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3楼2008-09-10 17:49:37
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alick1102

铜虫 (小有名气)
★
jghe(金币+1,VIP+0):谢谢参与讨论！
引用回帖:
Originally posted by sandycug at 2008-9-10 17:49:
将对称性调整一下，通常因为对称性太差导致计算很难收敛
或者先用分子动力学方法优化一下

或者换GGA优化一下

[ Last edited by sandycug on 2008-9-10 at 17:50 ]

GGA与收敛快慢关系不大，关键是你的初始构型。
不是分子动力学（molecular dynamics）优化，而是分子力学(Molecular mechanics)。这两者差别蛮大的：）
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到了博士的时候才知道，科学也不过是为了吃饭的。
4楼2008-09-10 18:33:49
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
引用回帖:
Originally posted by hora0212 at 2008-9-10 15:58:
按照我的经验,你的机器想把这个分子量奔下来,我估计一个月都不够
我这边有个4核的小服务器在算,超过80多个就不好优化了
时间都好几天
建议你撤了吧

楼主说分子量是200多，那么原子数也就几十个，还是能算动的，只不过在windows下计算的确是慢了点，
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
5楼2008-09-11 20:21:52
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joy412

银虫 (小有名气)
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
可以算的，主要是你的基组大啦点
你用6-31G试试应该会快很多的
我用你这个基组算了一个80个原子的结构3天都没出来
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6楼2008-09-12 08:23:24
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zhangdi6802

银虫 (小有名气)

【求助】先用PM3优化，后用HF，最后用DFT优化是否可行？

请教高手：问题如题，谢谢，昨天这么试了一下，在最后DFT优化时弹出一个内存引用错误的对话框，然后什么都没了，什么原因呢？ 感谢各位的帮助！！
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亮剑精神
7楼2008-09-12 09:27:48
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
推荐你使用LINUX系统版本的。

在LINUX系统下的内存错误，还可以有处理的方法，微软下，就有点麻烦了。
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Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
8楼2008-09-12 18:25:22
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spkeey

金虫 (正式写手)
到底多少个原子？

我 76 个 其中两个金属  b3lyp/6-31+G**  18 天，  奔腾2.8G 1000M内存。
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SPKEEY
9楼2008-09-12 21:31:02
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