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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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zhangdi6802

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】优化结构计算时间太长怎么办?

请教高手:我的这个物质分子量在200多,在Gview中画出图形后,直接进行优化计算,DFT/RB3LYP 6-31G+,进行的,算了十几个小时了,没有出结果,但也没有结果有死机,依然显示processing , 请问这正常吗,我的机器是cpu奔四 3.0G主频 内存2.0G  ,有没有更快的方法呢? 谢谢,十分着急!!

[ Last edited by lei0736 on 2008-9-11 at 11:31 ]
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亮剑精神
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sandycug

金虫 (小有名气)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
将对称性调整一下,通常因为对称性太差导致计算很难收敛
或者先用分子动力学方法优化一下

或者换GGA优化一下

[ Last edited by sandycug on 2008-9-10 at 17:50 ]
3楼2008-09-10 17:49:37
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hora0212

铜虫 (初入文坛)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
按照我的经验,你的机器想把这个分子量奔下来,我估计一个月都不够
我这边有个4核的小服务器在算,超过80多个就不好优化了
时间都好几天
建议你撤了吧
2楼2008-09-10 15:58:08
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alick1102

铜虫 (小有名气)


jghe(金币+1,VIP+0):谢谢参与讨论!
引用回帖:
Originally posted by sandycug at 2008-9-10 17:49:
将对称性调整一下,通常因为对称性太差导致计算很难收敛
或者先用分子动力学方法优化一下

或者换GGA优化一下

[ Last edited by sandycug on 2008-9-10 at 17:50 ]

GGA与收敛快慢关系不大,关键是你的初始构型。
不是分子动力学(molecular dynamics)优化,而是分子力学(Molecular mechanics)。这两者差别蛮大的:)
到了博士的时候才知道,科学也不过是为了吃饭的。
4楼2008-09-10 18:33:49
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

引用回帖:
Originally posted by hora0212 at 2008-9-10 15:58:
按照我的经验,你的机器想把这个分子量奔下来,我估计一个月都不够
我这边有个4核的小服务器在算,超过80多个就不好优化了
时间都好几天
建议你撤了吧

楼主说分子量是200多,那么原子数也就几十个,还是能算动的,只不过在windows下计算的确是慢了点,
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
5楼2008-09-11 20:21:52
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