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疯子J-F

木虫 (著名写手)

[求助] 330和1900两段overlap结果是这样,怎么改进呢? 已有2人参与

第一张是两片段胶回收产物电泳,后一张是overlap结果,片段比例10:1,退火温度用的55℃,求大神指点改进,谢谢了。。。

330和1900两段overlap结果是这样,怎么改进呢?
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330和1900两段overlap结果是这样,怎么改进呢?-1
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疯子J-F

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by kangaroo0513 at 2015-10-29 22:49:16
我设计的引物都是用于无缝克隆的,所以长度都在50-60bp,退火温度一般都在65-80度,没问题的。回收的时候根本不需要考虑比例,因为你overlap的时候有一个分子搭上了,后续就可以以这个为模板P得出来,就不会有问题! ...

好的谢谢,我试试

发自小木虫Android客户端
5楼2015-10-30 08:29:23
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kangaroo0513

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
疯子J-F: 金币+2, 有帮助 2015-10-29 21:33:22
你增加退火温度,或者gradient试试。一般两个条带我都是在同一个管子里回收的,然后用F1+R2做引物P一下就妥妥的。我一般都喜欢两步法,所以再设计引物的时候,都是把所有引物的TM设计在68度以上。这样会不用考虑退火的问题了。
2楼2015-10-29 14:50:30
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疯子J-F

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by kangaroo0513 at 2015-10-29 14:50:30
你增加退火温度,或者gradient试试。一般两个条带我都是在同一个管子里回收的,然后用F1+R2做引物P一下就妥妥的。我一般都喜欢两步法,所以再设计引物的时候,都是把所有引物的TM设计在68度以上。这样会不用考虑退火 ...

68℃的退火?我62℃都觉得够高了,一般都是50-60之间的退火,混在一起回收不用考虑比例的问题么

发自小木虫Android客户端
3楼2015-10-29 21:35:26
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kangaroo0513

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-10-29 23:04:49
疯子J-F: 金币+2, ★★★很有帮助 2015-10-30 08:28:51
我设计的引物都是用于无缝克隆的,所以长度都在50-60bp,退火温度一般都在65-80度,没问题的。回收的时候根本不需要考虑比例,因为你overlap的时候有一个分子搭上了,后续就可以以这个为模板P得出来,就不会有问题!无数次的经验了。
4楼2015-10-29 22:49:16
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