| 查看: 6329 | 回复: 4 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
红外测蛋白质二级结构含量谱图分峰的一些疑问 已有2人参与
|
|||
|
我是按论坛上一个教程（见附件）用peakfit操作的，但是有不少疑问 第一，应该如何确定子峰的数量呢？看了些帖子好像是用二阶导数谱来确定，我先去基线，平滑，再点击autofit peaks II second derivative，出来几个峰，就分为几个峰，这样对吗？ 第二，教程上是点击autofit peaks I residuals，再按左下角按钮连续拟合，但我看了论坛的一些帖子，好像要在拟合前去卷积，我在去基线，平滑后点击Deconvolve Gaussian IRF，结果基线又偏了，1600和1700cm-1的吸光度变成不在一个水平上（见图） 如果点击autofit peaks III deconvolve，只分出来3个峰，应该手动添加到8个峰再拟合吗（刚才二阶导数出来8个峰）？解卷积到底指Deconvolve Gaussian IRF还是autofit peaks III deconvolve呢？应该如何操作呢？ 第三，假设拟合结果如下， Peak Type Anlytc Area % Area Int Area % Area Centroid Moment2 1 Gauss Amp 2.86879875 9.20886981 2.84783555 9.16604874 1618.16180 47.7334086 2 Gauss Amp 5.25231552 16.8599801 5.25226973 16.9049650 1631.15830 50.2478218 3 Gauss Amp 6.49224137 20.8401532 6.49224137 20.8959400 1643.68294 50.2563044 4 Gauss Amp 6.81530055 21.8771761 6.81530054 21.9357389 1656.45800 50.2563040 5 Gauss Amp 5.69895628 18.2937009 5.69886173 18.3423668 1669.63916 50.2411853 6 Gauss Amp 4.02494820 12.9201199 3.96288238 12.7549405 1683.47738 45.9044148 Total 31.1525607 100.000000 31.0693913 100.000000 计算二级结构含量的方法是不是根据：1610～1640cm-1 为β-折叠；1640～1650cm-1 为无规则卷曲；1650～1660cm-1 为α-螺旋；1660～1700cm-1 为β-转角，得出peak1,2属于β-折叠，peak3属于无规则卷曲，peak4属于α-螺旋，peak5,6属于β-转角，再把对应的% Area加起来，得出β-折叠，无规则卷曲，α-螺旋，β-转角的含量，应该根据anlytc area还是int area 计算呢？ 求解惑，感激不尽，如完美解答，金币还会追加  1.png |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : peakfit分峰图像总结.doc
2015-10-25 22:59:02, 407.5 K
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 低维材料 |
» 猜你喜欢
食品学硕362求调剂
已经有3人回复
-
一志愿上海海洋大学083200食品学硕，求调剂，接受其他专业
已经有12人回复
-
食品科学论文润色/翻译怎么收费?
已经有60人回复
-
食品调剂08考数学可调
已经有0人回复
-
食品工程调剂
已经有2人回复
-
一志愿上海海洋大学083200食品学硕，求调剂，接受其他专业083200
已经有5人回复
-
广东海洋大学食品科学与工程、生物与医药招收调剂考生
已经有0人回复
-
欢迎调剂滁州学院生物与医药专硕
已经有0人回复
-
086003调剂求助
已经有8人回复
zxt546442323
银虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 307.7
- 帖子: 16
- 在线: 49.8小时
- 虫号: 5133590
- 注册: 2016-10-18
- 性别: GG
- 专业: 蛋白质组学
5楼2019-07-02 13:55:34
2楼2017-12-22 00:52:04
|
本帖内容被屏蔽 |
3楼2018-09-19 00:20:42
4楼2019-06-27 09:39:05
