| 查看: 6289 | 回复: 4 | |||
[求助]
红外测蛋白质二级结构含量谱图分峰的一些疑问 已有2人参与
|
|
我是按论坛上一个教程（见附件）用peakfit操作的，但是有不少疑问 第一，应该如何确定子峰的数量呢？看了些帖子好像是用二阶导数谱来确定，我先去基线，平滑，再点击autofit peaks II second derivative，出来几个峰，就分为几个峰，这样对吗？ 第二，教程上是点击autofit peaks I residuals，再按左下角按钮连续拟合，但我看了论坛的一些帖子，好像要在拟合前去卷积，我在去基线，平滑后点击Deconvolve Gaussian IRF，结果基线又偏了，1600和1700cm-1的吸光度变成不在一个水平上（见图） 如果点击autofit peaks III deconvolve，只分出来3个峰，应该手动添加到8个峰再拟合吗（刚才二阶导数出来8个峰）？解卷积到底指Deconvolve Gaussian IRF还是autofit peaks III deconvolve呢？应该如何操作呢？ 第三，假设拟合结果如下， Peak Type Anlytc Area % Area Int Area % Area Centroid Moment2 1 Gauss Amp 2.86879875 9.20886981 2.84783555 9.16604874 1618.16180 47.7334086 2 Gauss Amp 5.25231552 16.8599801 5.25226973 16.9049650 1631.15830 50.2478218 3 Gauss Amp 6.49224137 20.8401532 6.49224137 20.8959400 1643.68294 50.2563044 4 Gauss Amp 6.81530055 21.8771761 6.81530054 21.9357389 1656.45800 50.2563040 5 Gauss Amp 5.69895628 18.2937009 5.69886173 18.3423668 1669.63916 50.2411853 6 Gauss Amp 4.02494820 12.9201199 3.96288238 12.7549405 1683.47738 45.9044148 Total 31.1525607 100.000000 31.0693913 100.000000 计算二级结构含量的方法是不是根据：1610～1640cm-1 为β-折叠；1640～1650cm-1 为无规则卷曲；1650～1660cm-1 为α-螺旋；1660～1700cm-1 为β-转角，得出peak1,2属于β-折叠，peak3属于无规则卷曲，peak4属于α-螺旋，peak5,6属于β-转角，再把对应的% Area加起来，得出β-折叠，无规则卷曲，α-螺旋，β-转角的含量，应该根据anlytc area还是int area 计算呢？ 求解惑，感激不尽，如完美解答，金币还会追加  1.png |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : peakfit分峰图像总结.doc
2015-10-25 22:59:02, 407.5 K
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 低维材料 |
» 猜你喜欢
339食品求调剂到B区学校
已经有0人回复
-
0955求调剂
已经有1人回复
-
食品科学论文润色/翻译怎么收费?
已经有299人回复
-
0832食品调剂推荐
已经有0人回复
-
食品调剂-总分291-有中核论文导师一作、本人二作-一志愿南昌大学学硕-介绍详细
已经有12人回复
-
法国里尔大学_INRAE 2026招收食品方向CSC博士生
已经有0人回复
-
331求调剂，一志愿合工大食品工程（086003）
已经有2人回复
-
303分一志愿江南大学发酵工程学硕本科参加竞赛有实验室经历有酒厂质检员工作经历
已经有5人回复
-
331食品工程求调剂
已经有1人回复
-
一志愿福建农林大学 09 食品与营养 初试323
已经有0人回复
2楼2017-12-22 00:52:04
|
本帖内容被屏蔽 |
3楼2018-09-19 00:20:42
4楼2019-06-27 09:39:05
zxt546442323
银虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 307.7
- 帖子: 16
- 在线: 49.8小时
- 虫号: 5133590
- 注册: 2016-10-18
- 性别: GG
- 专业: 蛋白质组学
5楼2019-07-02 13:55:34
