24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1120  |  回复: 2

dong_chen

新虫 (正式写手)

[求助] cif文件用MS和diamond分别打开成键不一致 已有1人参与

小弟最近拿到一个MOFs 结构的cif文件,可是用MS和diamond两个软件打开后发现中心金属原子Ba的配位方式不一致,其在MS中是11配位,而diamond中显示是5配位,这该如何是好啊?解析晶体的人说没有A类B类错误cif应该是正确的,而且他用MS解出来也是11配位的,是需要我自己在diamond中调节什么参数吗?第一次遇到这种情况,希望各位大神帮助。
回复此楼
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

dong_chen

新虫 (正式写手)

dong_chen: 回帖置顶 2015-10-25 21:16:47
我自己设置好了。问题的本身是由于MS和diamond中对于配位键长的定义不同造成的,解决如下:
首先通过mercury量出缺失的配位键键长,当然MS应该也能只是我一直用mercury;
然后在diamond中的connectivity选项中改变要连接的两个原子之间的距离,选择correct now,删除之前的所有原子,重新get molecule.
此时可以找到缺失的配位键。
2楼2015-10-25 21:16:20
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by dong_chen at 2015-10-25 21:16:20
我自己设置好了。问题的本身是由于MS和diamond中对于配位键长的定义不同造成的,解决如下:
首先通过mercury量出缺失的配位键键长,当然MS应该也能只是我一直用mercury;
然后在diamond中的connectivity选项中改变 ...

用过diamond的人基本上都知道这一点,既然你已经解决了,可以申请关闭帖子了。
3楼2015-10-26 09:59:44
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dong_chen 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿双一流机械285分求调剂 +4 幸运的三木 2026-03-29 5/250 2026-03-29 14:49 by Miko19
[考研] 070300化学354求调剂 +6 101次希望 2026-03-28 6/300 2026-03-29 12:57 by 无际的草原
[考研] 311求调剂 +5 冬十三 2026-03-24 5/250 2026-03-29 08:55 by qingfeng258
[考研] 343求调剂 +5 爱羁绊 2026-03-28 5/250 2026-03-28 20:53 by 唐沐儿
[考研] 本科新能源科学与工程,一志愿华理能动285求调剂 +3 AZMK 2026-03-27 5/250 2026-03-28 16:19 by xxxsssccc
[考研] 085602 307分 求调剂 +7 不知道叫什么! 2026-03-26 7/350 2026-03-28 09:57 by 神马都不懂
[考研] 材料求调剂一志愿哈工大324 +7 闫旭东 2026-03-28 9/450 2026-03-28 08:51 by Xu de nuo
[考研] 0703化学/290求调剂/本科经历丰富/工科也可 +9 丹青奶盖 2026-03-26 10/500 2026-03-28 07:45 by barnett0632
[考研] 295求调剂 +5 1428151015 2026-03-27 6/300 2026-03-28 04:04 by fmesaito
[考研] 086000调剂 +3 7901117076 2026-03-26 3/150 2026-03-27 21:34 by Jianing_Mi
[考研] 07化学280分求调剂 +10 722865 2026-03-23 10/500 2026-03-27 15:51 by Plutoqq
[考研] 287求调剂 +10 land xuxu 2026-03-26 10/500 2026-03-27 15:33 by 帕尔马拉特
[考研] 333求调剂 +3 question挽风 2026-03-23 3/150 2026-03-27 11:29 by 不吃魚的貓
[考研] 333求调剂 +6 wfh030413@ 2026-03-23 6/300 2026-03-26 22:45 by 学员8dgXkO
[考研] 294分080500材料科学与工程求调剂 +4 柳溪边 2026-03-26 4/200 2026-03-26 21:14 by XPU李庆
[考研] 289求调剂 +17 硕星赴 2026-03-23 17/850 2026-03-26 16:18 by 不吃魚的貓
[考研] 318求调剂 +3 plum李子 2026-03-23 3/150 2026-03-25 09:42 by 雾散后相遇lc
[考研] 一志愿山东大学药学学硕求调剂 +3 开开心心没烦恼 2026-03-23 4/200 2026-03-24 00:06 by 开开心心没烦恼
[考研] 材料/农业专业,07/08开头均可,过线就行 +3 呵唔哦豁 2026-03-23 4/200 2026-03-23 22:30 by 汪!?!
[考研] 求老师收我 +3 zzh16938784 2026-03-23 3/150 2026-03-23 12:56 by ztnimte
信息提示
请填处理意见