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z631535213

木虫 (正式写手)

[求助] 请问下关于引物反义链的问题 已有1人参与

最近设计引物在纠结引物3号端不能落在密码子的3号位上,常规的DNA模版进行PCR。请教下引物反义链的问题

比如我在模版上游链A中选取的一段序列  5-AAAAACCCCC-3 和下游链B互补,发现落在A链中某密码子第3位,我想选用反义链B中的序列,那是5-TTTTTGGGGG-3还是5-GGGGGTTTTT-3。
但是前者不是形成图1的情况吗?后者的话不喊扩增区域。

不知道我哪个地方考虑错了,请大家帮帮忙!

请问下关于引物反义链的问题
IMG_0567.JPG
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z631535213

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ray540213374 at 2015-10-22 10:04:36
B链5gggggttttt3吧

这样扩增的话不就是不含有目标区域啦?
4楼2015-10-22 10:07:38
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z631535213

木虫 (正式写手)

还有,A链中的密码子第三位是不是就是B链的第一位?  比如A链中的AGG  对应B链中的CCT,这两个翻译的是不是一种氨基酸。
2楼2015-10-22 10:02:43
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ray540213374

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
B链5gggggttttt3吧
3楼2015-10-22 10:04:36
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