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DS-分子对接问题
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大家在做分子对接的时候,如果从PDB里下载的蛋白复合物是多聚体都怎么处理?是直接删除其他亚基、配体分子和水分子,还是需要对体系进行研究后才能确定?如果不删除也不会有影响吧对吗?有的配体分子存在于多个亚基中,在定义活性位点的时候是不是根据PDB数据库里配体分子展示的那条链中配体分子来定义是这样的吗? 如果做虚拟筛选,对于最后结果的出示只是前十位或者前多少位吗?是不是也可以根据阳性化合物对接后的打分,最后设定截断值确定最终筛选结果呢? 大家在挑选蛋白或者对接程序的时候有什么技巧吗? |
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2楼2015-10-22 17:07:59
冷血孤峰
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