24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 994  |  回复: 1

ynotshhhhh

新虫 (初入文坛)

[求助] Gromacs进行到能量最小化出现非法指令的提示,不知道是什么原因 已有1人参与

依照网上水的溶菌酶教程模拟,进行到能量最小化那步时,输入 mdrun -v -deffnm em后出现以下问题:
“Reading file em.tpr, VERSION 4.6.5 (single precision)
Using 1 MPI thread
Using 2 OpenMP threads
非法指令 (核心已转储)”

不知道是什么原因,跪求大神指点!
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

getengqing

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

可以在mdp文件中重新设置最小化参数(好像有个优化的终止条件吧),再进行优化,参数既不能太大也不能太小,
需要自己试验出来,由于已经几年没用gromacs了,具体怎么做的现在全忘光了···
一起交流学习/分享优秀资源
2楼2015-12-29 16:39:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ynotshhhhh 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂:085600材料与化工,考材科基,总分319 +15 678lucky 2026-03-31 18/900 2026-03-31 13:38 by JourneyLucky
[考研] 材料调剂 5+5 想要一壶桃花水 2026-03-25 11/550 2026-03-31 13:34 by Huaxue_Wang
[考研] 270求调剂 +3 小杰pp 2026-03-31 4/200 2026-03-31 12:59 by wxiongid
[考研] 一志愿西电085401数一英一299求调剂 六级521 +4 爱吃大鸭梨 2026-03-31 4/200 2026-03-31 11:51 by 搏击518
[考研] 287求调剂 +17 land xuxu 2026-03-26 17/850 2026-03-31 11:16 by Zzxxxs
[考研] 英一数一总分334求调剂 +3 陈阳坤 2026-03-31 3/150 2026-03-31 10:55 by jp9609
[考研] 282求调剂 +3 呼吸都是减肥 2026-03-31 3/150 2026-03-31 10:00 by wangjy2002
[考研] 085602化工求调剂(331分) +8 111@127 2026-03-30 8/400 2026-03-30 21:23 by 研究僧导导
[考研] 0703一志愿9,初试成绩:338,四六级已过,有科研经历,求调剂! +7 Zuhui0306 2026-03-25 7/350 2026-03-30 19:01 by 源_2020
[考研] 26考研-291分-厦门大学(085601)-柔性电子学院材料工程专业求调剂 +5 min3 2026-03-24 6/300 2026-03-30 18:42 by 544594351
[考研] 化学308分调剂 +7 你好明天你好 2026-03-30 8/400 2026-03-30 13:02 by 你好明天你好
[考研] 一志愿211,335分,0856,求调剂院校和导师 +7 倾____萧 2026-03-27 8/400 2026-03-30 09:37 by longlotian
[考研] 求调剂 +10 张zz111 2026-03-27 11/550 2026-03-30 09:17 by 无际的草原
[考研] 291求调剂 +5 Y-cap 2026-03-29 6/300 2026-03-29 13:18 by mumin1990
[考研] 330一志愿中国海洋大学 化学工程 085602 有读博意愿 求调剂 +3 wywy.. 2026-03-27 4/200 2026-03-28 03:32 by fmesaito
[考研] 279 分 求调剂 +4 睡个好觉_16 2026-03-24 4/200 2026-03-27 15:05 by 醉在风里
[考研] 309求调剂 +4 gajsj 2026-03-25 5/250 2026-03-26 00:27 by Dyhoer
[考研] 303求调剂 +6 蓝山月 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:47 by 418490947
[考研] 302求调剂 +4 锦衣卫藤椒 2026-03-25 4/200 2026-03-25 16:29 by 功夫疯狂
[考研] 求调剂 +3 李李不服输 2026-03-25 3/150 2026-03-25 13:03 by cmz0325
信息提示
请填处理意见