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ynotshhhhh

新虫 (初入文坛)

[求助] Gromacs进行到能量最小化出现非法指令的提示,不知道是什么原因 已有1人参与

依照网上水的溶菌酶教程模拟,进行到能量最小化那步时,输入 mdrun -v -deffnm em后出现以下问题:
“Reading file em.tpr, VERSION 4.6.5 (single precision)
Using 1 MPI thread
Using 2 OpenMP threads
非法指令 (核心已转储)”

不知道是什么原因,跪求大神指点!
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getengqing

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

可以在mdp文件中重新设置最小化参数(好像有个优化的终止条件吧),再进行优化,参数既不能太大也不能太小,
需要自己试验出来,由于已经几年没用gromacs了,具体怎么做的现在全忘光了···
一起交流学习/分享优秀资源
2楼2015-12-29 16:39:40
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