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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 综合其他 » 调查：《计算晶体学》
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hli263

金虫 (小有名气)

[交流] 调查：《计算晶体学》 已有17人参与

本人在学校开设研究生课程《计算晶体学》，但是国内外没有现成教材。我打算写一本，不知道大家感觉需不需要？想调查一下。

基本内容：介绍在晶体学里进本的公式、理论及计算算法。有部分核心代码（Fortran, Visual Basic开发）

第一章  原子散射因子及结构因子
           主要介绍原子散射原理，9系数法原子散射因子计算公式，国际晶体学表C卷原子散射因子列表，计算代码
第二章  群论，空间群
           主要介绍群论进本知识，群论的矩阵表达方法及公式，编写原子坐标对称性操作计算代码。
          （完成前两章后，可以独立编写单晶衍射，粉末衍射模拟计算软件）
第三章  Fourier变换及卷积理论 （没啥好说的）
第四章  晶体结构解析方法
           介绍三种晶体结构解析方法的理论背景，原理。
        1 直接法 2 Patterson法，3 charge flipping法（HIO/ER法）
         （完成三、四章可以独立编写charge flipping及patterson算法代码）
第五章  图像清晰度理论及其应用
        从Abbe原理出发，换个角度看待晶体结构解析问题及结构解析方法。详见精华帖
第六章  最大熵理论及其在晶体学中的应用
        介绍最大熵基本理论，计算公式，代码设计。介绍用最大熵理论进行晶体电荷密度分析基本过程，研究晶体中的化学键性质研究（如离子键，共价键，金属键的确  定，电负性的确定，AIM理论）

第七章 I.Brown的价键理论
        介绍价键理论，用该理论研究锂离子电池材料的离子通道的基本方法及计算代码
第八章 密度泛函理论
         重点介绍我们设计的无轨道密度泛函（Orbital Free-DFT）计算代码

上述各章节我们都给出我们设计开发的代码作为参考，以助于大家掌握或应用
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1楼 2015-10-13 08:28:18
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sigmax

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
国际晶体学表如何使用应该给出一些具体而详细的指导。否则大部分人还是不会用。

群论很重要，现在的讲法只能让人接受已有的结果，似乎很难利用群论工具去开展新的研究-比如，如何从分子对称性推测晶体空间群。

实空间解析晶体结构对于有机分子晶体而言不难，用波谱、光谱和元素分析就能知道分子的初始结构，只要指标化正确，余下的就是计算机自动搜索的精修过程。现在计算机能力提高，如果有并行或者GPU加速，那做网格搜索更保险。

期待尽快出版。
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10楼2015-12-07 09:56:58
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查看全部 22 个回答

hli263

金虫 (小有名气)
上述计算代码都是我自己编写的。所以有切身感受和一手实战经验
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2楼2015-10-13 08:37:36
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hanhaixf-77

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
sty112: 金币+5, 鼓励交流 2016-01-19 13:21:45
个人建议如下：
（1）大部分计算的理论和代码等有公用的代码库可以调用，比如FOX、Fullprof等都是基于这些代码库发展的，作为教材，我觉得应该提及，让学生有所选择，如果能介绍使用，则更好了；
（2）计算晶体学的基本东西不要抛弃——因为大多数论文，所需要的实际上就是键长键角、晶胞大小、晶面间距、晶面原子密度等基本的东西，对于晶体学家来说，这是小儿科，但是对于搞材料的，这却是大问题——他们拿着cif文件都不知道如何算！假定有人使用你这本书发展晶体计算的软件，这些基本的反而是必须提供的功能；
（3）晶体结构解析方法应该添加正空间法；图像清晰度的介绍应该考虑传统的R因子以及各类改进的R因子，比如导数最小值R因子；
总体上说，我觉得你提的内容更像一本专著，或者属于高级别研究生用的教材，（收亲传徒弟使用的武林秘籍，开宗立派，^_^）。
以上纯属个人拙见，还请不要见怪
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3楼2015-10-13 09:47:02
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hli263

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by hanhaixf-77 at 2015-10-13 09:47:02
个人建议如下：
（1）大部分计算的理论和代码等有公用的代码库可以调用，比如FOX、Fullprof等都是基于这些代码库发展的，作为教材，我觉得应该提及，让学生有所选择，如果能介绍使用，则更好了；
（2）计算晶体学 ...

谢谢谢谢。
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4楼2015-10-13 10:09:30
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