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chavid

金虫 (正式写手)

[求助] DS 2.5 clean protein 和对接结果 已有2人参与

新手分子对接,发现protein utilities里面的clean protein功能点了没反应(就是蛋白构象提出,加H,补充不完整的残基等)。重装后也不行,所有路径都是英文。另外我用小分子和蛋白的对接结果里面,小分子全在蛋白表面,根本没进去那个结合球,和已经报道的蛋白和小分子的共晶结合差的十万八千里(我的结合球是按照报道的共晶来设置的,而且我的化合物比报道的小分子还要小,不可能进去不了的)。折磨我好几天了,先发50G币,真有人帮我解决了再送100G
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药物化学导向的化学生物学
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珍维永久

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

1. protein utilities中选项需要打钩勾选
2. 是否选中蛋白了,当前的活动窗口
6楼2015-10-21 15:00:09
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wadecau

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chavid: 金币+5, 有帮助 2015-10-14 13:24:58
clean protein 要先在preference-protein utility-clean protein里面设置一下才行的。那里面有加氢什么的的选项,都在那了,打钩就行了
对接就不太知道,我也才开始学。。。
2楼2015-10-11 00:13:06
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308866814

新虫 (初入文坛)

楼主用的win10吧,换换win7试一下行不行,我用10跑步出来结果,换操作系统后就好啦。

发自小木虫Android客户端
3楼2015-10-13 10:29:27
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chavid

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 308866814 at 2015-10-13 10:29:27
楼主用的win10吧,换换win7试一下行不行,我用10跑步出来结果,换操作系统后就好啦。

我的就是win7啊
药物化学导向的化学生物学
4楼2015-10-14 13:25:10
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