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ted790110

铜虫 (初入文坛)

[求助] 引子设计逻辑? 证明template是mRNA?

快被老板搞疯了

最近在做RT(reversetranscription不是real time) - PCR
材料是突变的原核杆菌,没有内外显子问题。
有拿去定序,结果在一个表现基因(暂称X基因) 末段缺了一小部份,
连同terminator sequence都没了。
就在猜会不会X基因的terminator sequence没了,transcription会接续到下一个表现基因(暂称Y基因),
然后做出X、Y基因连在一起的mRNA。

于是开始设计第一对A引子
小弟是在X基因放一个forward,Y基因放一个reverse,如果X、Y基因连在一起做mRNA,PCR就会有东西(第3条);
如果是正常的,X、Y基因就是分开两条的mRNA,PCR不出东西(第1、2条)。

因为正常的mRNA用A引子做RT-PCR没有东西
没办法知道是否真的有X、Y基因的mRNA (第1、2条),
于是在X基因中设计一对B引子(第5、6、7条),Y基因中设计一对C引子(第9、10、11条)
证明X、Y基因是否有transcription出mRNA。
(第4、8、12条是NC)
结果老板说我的RT-PCR结果无法让人信服是以mRNA为template。

这要怎么让人信服啊?

引子设计逻辑? 证明template是mRNA?
AUTO6762.jpg
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