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求助。关于乳酸菌。 已有1人参与
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我做的是奶酪中筛非发酵剂乳酸菌。但是现在筛出来的菌测序之后用blast比对出来后几乎全是表皮葡萄球菌，要不就是不可培养细菌。然后我的引物是v3-v4区， Nobar-341F（CCTACGGGNGGCWGCAG）。 Nobar-805R（GACTACHVGGGTATCTAATCC）。大家觉得我的引物有问题嘛？是不是应该用乳酸菌的通用引物呢？ |
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huangjixiang
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王kittyelva(99503102代发): 金币+5, 谢谢应助，希望继续关注楼主问题！ 2015-09-26 22:37:57
王kittyelva: 金币+5, ★有帮助 2015-10-09 17:24:11
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王kittyelva: 金币+5, ★有帮助 2015-10-09 17:24:11
| 个人感觉引物问题不大，乳酸菌用常见的通用引物就可以鉴定。极可能是筛选条件有问题，不利于乳酸菌生长。nslab一般是lactococcus属和lactobacillus属的，lactococcus属的菌株25℃培养，lactobacillus可以用专门的筛选培养基试试，例如sl或酸化mrs。最好厌氧。 |
2楼2015-09-25 15:01:27
3楼2015-10-09 17:24:17
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王kittyelva(99503102代发): 金币+2, 谢谢参与交流，以后可以应助回帖哦！ 2015-10-10 11:33:10
王kittyelva(99503102代发): 金币+2, 谢谢参与交流，以后可以应助回帖哦！ 2015-10-10 11:33:10
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那就是问题出现在筛菌了，你要纯化镜检生理生化鉴定差不多了是乳酸菌再去测序啊！乳酸菌一般用细菌通用引物就可以 发自小木虫Android客户端 |
4楼2015-10-09 23:07:23
顾影—ME
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