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王kittyelva

银虫 (初入文坛)

[求助] 求助。关于乳酸菌。 已有1人参与

我做的是奶酪中筛非发酵剂乳酸菌。但是现在筛出来的菌测序之后用blast比对出来后几乎全是表皮葡萄球菌,要不就是不可培养细菌。然后我的引物是v3-v4区,
Nobar-341F(CCTACGGGNGGCWGCAG)。 Nobar-805R(GACTACHVGGGTATCTAATCC)。大家觉得我的引物有问题嘛?是不是应该用乳酸菌的通用引物呢?
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huangjixiang

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
王kittyelva(99503102代发): 金币+5, 谢谢应助,希望继续关注楼主问题! 2015-09-26 22:37:57
王kittyelva: 金币+5, 有帮助 2015-10-09 17:24:11
个人感觉引物问题不大,乳酸菌用常见的通用引物就可以鉴定。极可能是筛选条件有问题,不利于乳酸菌生长。nslab一般是lactococcus属和lactobacillus属的,lactococcus属的菌株25℃培养,lactobacillus可以用专门的筛选培养基试试,例如sl或酸化mrs。最好厌氧。
2楼2015-09-25 15:01:27
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王kittyelva

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by huangjixiang at 2015-09-25 15:01:27
个人感觉引物问题不大,乳酸菌用常见的通用引物就可以鉴定。极可能是筛选条件有问题,不利于乳酸菌生长。nslab一般是lactococcus属和lactobacillus属的,lactococcus属的菌株25℃培养,lactobacillus可以用专门的筛 ...

谢谢啦。
3楼2015-10-09 17:24:17
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fancy9200

新虫 (初入文坛)

★ ★
王kittyelva(99503102代发): 金币+2, 谢谢参与交流,以后可以应助回帖哦! 2015-10-10 11:33:10
那就是问题出现在筛菌了,你要纯化镜检生理生化鉴定差不多了是乳酸菌再去测序啊!乳酸菌一般用细菌通用引物就可以

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4楼2015-10-09 23:07:23
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顾影—ME

木虫 (著名写手)


王kittyelva(99503102代发): 金币+1, 鼓励交流! 2015-10-10 11:33:43
对,试试乳酸菌通用引物

发自小木虫Android客户端
为了不让自己所爱的人被别人的钱诱惑,努力学习早日富有
5楼2015-10-09 23:32:15
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