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小白求真菌分子鉴定结果分析,大神们多多指导,谢谢已有2人参与
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我筛到一批真菌菌株,做了18srDNA分子鉴定,片段基本都是500多bp,在ncbi上比对分析,大部分菌的ident一栏都是100%,99%的,有一个菌的是96%或以下,且是对应的多是Uncultured fungus genes,形态观察看不出像是什么真菌,感觉鉴定这个菌好难啊,求高人多多指导,我下面该怎么开展实验呢,另外构建进化树的话,我想把这筛的这些菌和已报道的菌进行聚类分析,就是出一张图,该用什么软件呢, 谢谢啦。 ![]() |
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肥猫p
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【答案】应助回帖
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感谢参与,应助指数 +1
finding1371: 金币+1, ★★★很有帮助, 非常感谢~ 2015-09-24 21:24:23
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你确定18s那么短?测个全长试试,还有你可以再测一下ITS全长,如果结果都差不多,那就可能是一个新种,再进一步的做做形态鉴定,可以发表一篇sci 发自小木虫Android客户端 |

3楼2015-09-24 09:11:39
4楼2015-09-24 21:24:13
5楼2015-09-24 21:29:09














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