24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 927  |  回复: 4

finding1371

银虫 (小有名气)

[求助] 小白求真菌分子鉴定结果分析,大神们多多指导,谢谢 已有2人参与

我筛到一批真菌菌株,做了18srDNA分子鉴定,片段基本都是500多bp,在ncbi上比对分析,大部分菌的ident一栏都是100%,99%的,有一个菌的是96%或以下,且是对应的多是Uncultured fungus genes,形态观察看不出像是什么真菌,感觉鉴定这个菌好难啊,求高人多多指导,我下面该怎么开展实验呢,另外构建进化树的话,我想把这筛的这些菌和已报道的菌进行聚类分析,就是出一张图,该用什么软件呢,
谢谢啦。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

课题相关

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

肥猫p

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
finding1371: 金币+1, ★★★很有帮助, 非常感谢~ 2015-09-24 21:23:18
我觉得 真菌的分子鉴定,ITS比18S好吧。进化树我用MEGA
2楼2015-09-23 23:47:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

20093651

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
finding1371: 金币+1, ★★★很有帮助, 非常感谢~ 2015-09-24 21:24:23
你确定18s那么短?测个全长试试,还有你可以再测一下ITS全长,如果结果都差不多,那就可能是一个新种,再进一步的做做形态鉴定,可以发表一篇sci

发自小木虫Android客户端
但行好事,莫问前程
3楼2015-09-24 09:11:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

finding1371

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 肥猫p at 2015-09-23 23:47:46
我觉得 真菌的分子鉴定,ITS比18S好吧。进化树我用MEGA

谢谢了,不好意思,我说错了,用的是ITS1 4 引物扩的
4楼2015-09-24 21:24:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

finding1371

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 20093651 at 2015-09-24 09:11:39
你确定18s那么短?测个全长试试,还有你可以再测一下ITS全长,如果结果都差不多,那就可能是一个新种,再进一步的做做形态鉴定,可以发表一篇sci

谢谢,我说错了,是ITS序列,一般同源性低于多少可能是新种呢,现在就想赶紧补实验,捉急没论文呢,另外想问下,测出的ITS序列,能分析ITS1 ,5.8S 和ITS2 区碱基间隔吗,求多指教,非常感谢啦~
5楼2015-09-24 21:29:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 finding1371 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿北化085600材料专硕275|有文章专利|求调剂 +15 Micky11223 2026-03-25 16/800 2026-03-31 12:15 by oooqiao
[考研] 材料专硕调剂 +12 椰椰。 2026-03-29 12/600 2026-03-31 10:52 by foria
[考研] 293分求调剂,外语为俄语 +5 加一一九 2026-03-31 5/250 2026-03-31 09:39 by zhshch
[考研] 335求调剂 +3 321* 2026-03-31 3/150 2026-03-31 09:00 by 功夫疯狂
[考研] 材料科学与工程求调剂 +10 深V宿舍吧 2026-03-29 10/500 2026-03-31 04:08 by fmesaito
[考研] 279求调剂 +12 j的立方 2026-03-29 12/600 2026-03-30 20:30 by dick_runner
[考研] 311求调剂 +7 蓝月亮亮 2026-03-30 7/350 2026-03-30 19:24 by 无际的草原
[考研] 328求调剂 +8 嗯滴的基本都 2026-03-27 8/400 2026-03-30 17:20 by Wang200018
[考研] 求化学调剂 +11 wulanna 2026-03-28 11/550 2026-03-30 10:59 by 探123
[考研] 求调剂 +10 张zz111 2026-03-27 11/550 2026-03-30 09:17 by 无际的草原
[考研] 本科新能源科学与工程,一志愿华理能动285求调剂 +7 AZMK 2026-03-28 11/550 2026-03-28 21:01 by xxxsssccc
[考研] 本科新能源科学与工程,一志愿华理能动285求调剂 +3 AZMK 2026-03-27 5/250 2026-03-28 16:19 by xxxsssccc
[考研] 086502化学工程342求调剂 +6 阿姨复古不过 2026-03-27 6/300 2026-03-28 07:06 by wangy0907
[考研] 285求调剂 +4 AZMK 2026-03-27 7/350 2026-03-27 20:59 by AZMK
[考研] 一志愿南师大0703化学 275求调剂 +4 Ripcord上岸 2026-03-27 4/200 2026-03-27 17:00 by zhyzzh
[考研] 279 分 求调剂 +4 睡个好觉_16 2026-03-24 4/200 2026-03-27 15:05 by 醉在风里
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-26 3/150 2026-03-26 19:57 by nihaoar
[考研] 303求调剂 +6 蓝山月 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:47 by 418490947
[考研] 334分 一志愿武理-080500 材料求调剂 +4 李李不服输 2026-03-25 4/200 2026-03-25 21:26 by 星空星月
[考研] 296求调剂 +4 汪!?! 2026-03-25 7/350 2026-03-25 16:41 by 汪!?!
信息提示
请填处理意见