24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 928  |  回复: 4

finding1371

银虫 (小有名气)

[求助] 小白求真菌分子鉴定结果分析,大神们多多指导,谢谢 已有2人参与

我筛到一批真菌菌株,做了18srDNA分子鉴定,片段基本都是500多bp,在ncbi上比对分析,大部分菌的ident一栏都是100%,99%的,有一个菌的是96%或以下,且是对应的多是Uncultured fungus genes,形态观察看不出像是什么真菌,感觉鉴定这个菌好难啊,求高人多多指导,我下面该怎么开展实验呢,另外构建进化树的话,我想把这筛的这些菌和已报道的菌进行聚类分析,就是出一张图,该用什么软件呢,
谢谢啦。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

课题相关

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

肥猫p

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
finding1371: 金币+1, ★★★很有帮助, 非常感谢~ 2015-09-24 21:23:18
我觉得 真菌的分子鉴定,ITS比18S好吧。进化树我用MEGA
2楼2015-09-23 23:47:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

20093651

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
finding1371: 金币+1, ★★★很有帮助, 非常感谢~ 2015-09-24 21:24:23
你确定18s那么短?测个全长试试,还有你可以再测一下ITS全长,如果结果都差不多,那就可能是一个新种,再进一步的做做形态鉴定,可以发表一篇sci

发自小木虫Android客户端
但行好事,莫问前程
3楼2015-09-24 09:11:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

finding1371

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 肥猫p at 2015-09-23 23:47:46
我觉得 真菌的分子鉴定,ITS比18S好吧。进化树我用MEGA

谢谢了,不好意思,我说错了,用的是ITS1 4 引物扩的
4楼2015-09-24 21:24:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

finding1371

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 20093651 at 2015-09-24 09:11:39
你确定18s那么短?测个全长试试,还有你可以再测一下ITS全长,如果结果都差不多,那就可能是一个新种,再进一步的做做形态鉴定,可以发表一篇sci

谢谢,我说错了,是ITS序列,一般同源性低于多少可能是新种呢,现在就想赶紧补实验,捉急没论文呢,另外想问下,测出的ITS序列,能分析ITS1 ,5.8S 和ITS2 区碱基间隔吗,求多指教,非常感谢啦~
5楼2015-09-24 21:29:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 finding1371 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 311求调剂 +3 李芷新1 2026-03-31 3/150 2026-03-31 15:16 by fmesaito
[考研] 一志愿华东理工大学,080500学硕,317分,求调剂 +7 s1145 2026-03-31 7/350 2026-03-31 14:38 by fmesaito
[考研] 085600 295分求调剂 +13 W55j 2026-03-30 15/750 2026-03-31 13:29 by 王亮_大连医科大
[考研] 张芳铭-中国农业大学-环境工程专硕-298 +8 手机用户 2026-03-26 8/400 2026-03-31 12:40 by 331429
[考研] 289求调剂 +6 BrightLL 2026-03-29 6/300 2026-03-31 11:22 by oooqiao
[考研] 08工科求调剂286 +5 tgs_001 2026-03-28 5/250 2026-03-31 08:18 by 一只好果子?
[考研] 一志愿华中师范化学332分求调剂 +3 Lyy930824@ 2026-03-29 3/150 2026-03-30 20:15 by DHUSHUAI
[考研] 085601材料工程找调剂 +17 oatmealR 2026-03-29 18/900 2026-03-30 19:21 by Wang200018
[考研] 求调剂323材料与化工 +10 1124361 2026-03-24 10/500 2026-03-30 16:26 by 690616278
[考研] 085701求调剂初试286分 +5 secret0328 2026-03-28 5/250 2026-03-30 12:54 by fangnagu
[考研] 332求调剂 +6 Lyy930824@ 2026-03-29 6/300 2026-03-30 10:53 by 1172367218
[考研] 296求调剂 +10 彼岸t 2026-03-29 10/500 2026-03-30 10:50 by 探123
[考研] 2026年华南师范大学欢迎化学,化工,生物,生医工等专业优秀学子加入! +3 llss0711 2026-03-28 6/300 2026-03-29 10:26 by llss0711
[考研] 调剂考研 +3 王杰一 2026-03-29 3/150 2026-03-29 08:09 by fmesaito
[考研] 316求调剂 +7 江辞666 2026-03-26 7/350 2026-03-28 21:28 by sanrepian
[考研] 材料与化工(0856)304求B区调剂 +8 邱gl 2026-03-27 8/400 2026-03-28 12:42 by 唐沐儿
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-27 7/350 2026-03-28 07:43 by 热情沙漠
[考研] 265求调剂11408 +3 刘小鹿lu 2026-03-27 3/150 2026-03-27 20:53 by nihaoar
[考研] 305求调剂 +5 哇卢卡库 2026-03-26 5/250 2026-03-27 14:01 by laoshidan
[考研] 求b区院校调剂 +4 周56 2026-03-24 5/250 2026-03-25 17:12 by yishunmin
信息提示
请填处理意见